Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0002600
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0065247 hsa_circSMARCC1_018 hsa-SMARCC1_0086
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47651556-47814426 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47610066-47772936 UCSC (hg38)
External Database
circbank circBase

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-791.5 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -844.8 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 642.5
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..((((((((((..((((...........(((((((((((((((((.((....(((((........))))).((((..(((((((((((((.......(((((((.(((...((((((........(((((..........((((..(((((((((.(.......).)))))).)))..).)))......)))))))))))))).)))))))))))............((((((((((.((.(((((.(((((((((....))))))..........((((.((((.......))))))))((((((((((........((((.((((((.((((..((((........))))...))))((((((.....(((((((((..........((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.((((((((....(((.((.....)).)))..((((...................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..)))))))))))))(((....)))..(((.((.(....(((((((((.((((((.((((.......((((((...)))))).....))))..))))....))..)))))))))....).)).))))))))))).)))).))))))))......))))))...))).)))))))).(((((..(((((...((.((((((..(((.((.(((((((((..................((((((((((((..(((((((((....(((((((((.((((..(.((((...............)))).)..))).).))))((((((.......)))))).(((((((.((..............((.((((..........))))..)).(((...(((.....)))...))).....................)).))))))).....)))))..............(((......)))((((((.((......)).)))))).....((((((((((((.........)))...((((((.................))))))...((.(((((......))))).)).(((((((((.((((.(((((.(((((((..((((((((((...(((....(((((((.((((.....))))))))))))))...))))))))....))..)))))(((((((.....)))..)))).........(((((..............)))))((((.........))))..)).)))))...))))....))))))).))............)))))))))((((((((((..(.((.(((.((.(((...(((((((..(((((((((....)).))).))))..)))))))..))))).)))..)).)..))))...(((((....)))))...))))))...))))).))))...))))))))))))......))))))))).))...)))..)))))).))..((((((........((((....)).))........))))))........((.....)).))))))))))........(((((((((.(...(((((.(((((.(....((((((((...........)))))))))))).)).)))))....).)).)))))))((((((....))))))))))...))))).....))))))........)))))))))).)))))))..)))((.(((((((((....))))).........)))))).))))))))..)).))))...))))))......)))))))))..)))).....))))))))))).........)))))))).)))).)))).).))))))))(((.((((.....)))).(((.((((((.......((((((((((((((.......)))))...((.((.((......((((..((((((.((.....(((...(((((.((.((((((((((.....((.((..(((((((....(((((((.....((((...))))....(((((.((((((((((((..(((.(((....((((((.....((.....(((((....))))).....))......)))..((.((((.....)))).)).((((....))))..........(((.........((........)).......)))........................((........))......(((.(((((((............((((............))))............)))))))..))).................((..((((...........))))..)).....((((((...))))))...)))...))))))))))))))))))(((.....)))(((...(((((......)))))...)))..........)))))..((((.((((((.(((((.((((....((....))....))))))))).....((((((....)))))).........)))))).))))..((((.......)))).......)))))))....)))))))..)).))(((.....(((((..(((....((((..((..(((........)))))..))))...((......))...((..((((((...((((...((((......)).))...))))..))))))..)).)))..)))))......)))....)))))))).)).)))))))))))).)))))).))))......)).)).))))))))))).......)))))).))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.,,({..((.(({...}))...)}.....,.)(((((((((.((((((((((((((({{(((....(((......)))))))))))).)).))))}..,.(((((((.(((...((((((........(((((...,{,....((({.{(((((((((.{.......}.)))))).)))}.),}))......)))))))))))))).))))))}.}..(((((..((((((.....}})).,.))..))))).((((((....}))))).........{((((.({(({(....))))))))),.......((((.((((((((((..((((.,{|{,.,,(({.....}},{||{,,{{{(((((,{,..{({((((({.,.,{,{{{{,{((({.(((((.....))))),{(((...((((,(({,,{(((((.((.......)).))))))))).})}}...))))...........,...(((((((((..((.(((((.......)))))...))..))))))))).,))}.,.}},,})}))))).},,}},..{{,{{({(((({{,.{((((.....,{{.|||,.}})}|,}}.},,.))))})))})}...})))))))))))).,,)),.}}))))))).)))}.{((((((((......(((((...)))))((((....(((((((((..,,......||.{(((((,,{((.((.(((((((((................,.((((((((((((..(((((((((....{((((((((.((((..{.((((...............)))).)..))).).))))((((((.......)))))).(((((((.((.....{{.......({.((((..........))))..}}.,{{...(((.....)))...}||{{{.....,,,,,........)).))))))).....}}}},..........|,,.(((......)))((((({.((......)).}))))).,...((((((((({.{,......,,|||,,.((((((...........,.....))))))...{{.(((((......))))).}},||(((((((.{(((.(((((..{(((((..((((((((((.,.{{{...{(((((((.((((.....))))))))))))}}...)))))))),...})..)))))}||{{((({,{{,...((((.........))))}}}})},}},......,||||{{,{,,,......}}}),,,}.))})),,.)))}....))))))).}}...,.,,,....)))))))))((((((((((..(,((.(((.((.(((.,.(((((((..(((((((((....)).))),))))..)))))))..})))).)))..}),),.))))...(((((....)))))...))))))...))))).))))...)))))))))))).,....))))))))).))...)))}.)))))}.}}{,{..((((({{(((...(((((...{{.....(((((((..........)))))))..}})))))...))))))))),))),)))),.}))))....))))...............(((((((({.((((((.{{((((((......,.((((((,((((((.........))))))(((((((.((.((.(({{,{{{{({.{{,{..{,,.{{{{,,{,.|,|,,,(((((((.,....((((((....))))))........,}.))))))),}},,.|,.}},)},)}))),...,}}...))).))))..))))))).(((......))).......}}))))),,}}......)))))}.,,.)))))).})))))))}(((((((((((((({((((((.{(.{((...((((........}))}))}.}})))).}}}..,..((((..((((((.(({.,,.,{{...{((({{((.((((((((((.{...((.({..(((((((....(((((((,{,..((((...}}}}},,}{{|||.((((((((((((..(((.(((....((((({.,...((.....(((((....))))).....))......)))..((.((((.....)))).)).((((....))))..........(((,.........{........{{{......)))........................{{........}}...,,.(((.(((((((............((((............))))............)))))))..))).},,.............((..((((...........))))..)).....((((((...)))))).,,})),,.))))))))))))))))))|||.,.,{||((((,..(((((......)))))...|}||,.,.........})..{|||.||||||,{((({{((((....,,....}}....))))))))}.....((((({....)))))).,,},....}}}}}}.}}}}.,(({{.......)))).......)))))))....)))))))..)).)){((.....(((({..{||,...((((..({.{(((........)))))..))))...||.....,}....((..((((((...((((...((((......)).))...))))..))))))..)).}}}..}))}}..,..,)))....)))))))).)).))))))}}}))).)))))).)))).......)))))}})))))))))))))))))))).)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.