Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0007700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0065253 hsa_circSMARCC1_088 hsa-SMARCC1_0253
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47677512-47727660 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47636022-47686170 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-347.2 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -371.66 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 338.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((....((((((......)).))))((.(((((....)))))))((((((.((((((((((..(.......)..)))))))))).)))))).....(((.(.(.(((((((((((..((....))))))))))))).).)))))))))((((((((((((.((((.........)))).........((((((.(((((((((.........))))...(((.......))).......))))).)))))).(((..((((((((((.(((((.((((..(.((.(((.((.(((...(((((((..(((((((((....)).))).))))..)))))))..))))).)))..)).)..))))...(((((....))))).)))))((((..((((.(((((...(((((....)))))...(((((..(((((((.....(((((((.(((...((((((((.(((...(((((...((.....(((((((..........)))))))..)))))))...))))))))..(((((((((.(...(((((.(((((.(....((((((((...........)))))))))))).)).)))))....).)).))))))).(((((((...((((((.(((((..(.(.((((((((...((..(..((((............(((((((.((...((((((....))))))........)).)))))))))))..)..))))).)))))).).)))))..))))))..((((((...))))))(((.....(((.((((((((..((((......((((.......))))..(((((((((((.((.((.(.((.((((...(((...(((((((((((....((.(((((....(((((((..(.(((((((..((.....)).)))).))).)..))))))).................))))).))....(((((((((...((((.......))))..))))))).)).))))))..))))))))))))))).)))))))))))))))))))..)).)))))).))).....)))..((.((((.....)))).)).((((....)))).........)))))))..)))....)))))))))).....))))))).))))).........))))))).))..))))))))).))))).)))...)))))).))....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,{{....,{||(({.,...||{||||...,,,||}},.|||||{((((((,,(((,(((((,.,({({{..{{{{||||||,},|{|,,,|{((((((.((({.....}))}})))))}},}...))))))))},,,,).,))))))||((((({{(({,..((((.........))))}}}}}}.,,{,,,,,.{{{{{{{,{.,.......}}}),,,|.}}}}},,.))},....}}))))).)}}}}}.|||.,({{{{{{{{(.((((((((((..(,((.(((.((.(((...(((((((..(((((((((....)).))),))))..)))))))..})))).)))..)),),.))))...(((((....))))).,.))))))..,((((((((({...(((((....}}}}},..(((({..(((((((.....(((((((,{((...{(((((({{(((...(((((...{{.....(((((((..........)))))))..}})))))...)))))))),.(((((((((.{.,.(((((.(((({,(....((((((((...........))))))))))))},).)))))..,.}.)).))))))).(((((((...((((((.(((((..,.(.((((((((..,{(..{..,(({{,.,.,,,,,,.(((((((.,,...((((((....))))))........,}.)))))))}}},..},.})))).)))))}...)))))..))))))..{(((((...)))))}(((.....(((.((((((((..((((......((((.......))))..(((((((((((.((.((.(.((.((((.,,{{({(.{{((((((.,{....||,||{({{,.,{((((((,,(.(({((((..((.,,..||,||}},.}},|,.}}}||||.{,||,,....}.,,,.}..))}})}.,}))},|{{{{,.,||||.,})),}},.},|||||}||,||.}}})).,}}))})).,))))))).)))))))))))))))))))..)},)))))).))).....)))..((.((((.....)))).)).((((....)))).........)))))))..,}}....)))))))))).....))))))).}))))...,,..........,,,....}},})))}.))))).,}}))))))))),}}....})))
Forensic Context

No forensic context available.