Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0008200
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0065255 hsa_circSMARCC1_111 hsa-SMARCC1_0150
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47680215-47718272 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47638725-47676782 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-244.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -261.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 233.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......)((((((((.((((((((((...(((((((....)))))))..(((..(..(.(((((....))))).)..).)))...)))))))).....(((((....)))))..(((((((((((((((((((((.(((((((((.((..((((((.(((((((...((((((((...(((((((..........)))))))...)))..)))))(((.(((((((..(((..((((((......((((.(....((((((((...........)))))))))))))...(((.((((....((((((.........))))))(((((((.((.((.(((((((((((...((..(..((((............(((((((.((...((((((....))))))........)).)))))))))))..)..))))).)))))..........))).))))..))))))).(((......))).))))..))).))))))..)))...))).....)))).))).((((((((((((((((((((((...((((.((.(((....(((((.......)))))..(.(((((...))))).)))))).))))...)))))).)))...............))))))))))))).....))))))).))))))..))....((((...))))....)))).))))))))).........))))))).))))).............(((((....)))))..)))))...........((.((((.....)))).)).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.......)((((((((.((,{{((((,.,.(((((({....}))}||)..(({..{,,{.(((((....))))).,.}},}})}}}}||||},,,....{{|||,,,.))}}),,|((((((((((((((((((((.(((((((((.((..((((((.((((((({.((((((((({,.(((((((..........)))))))...|({{.,||||.,{,,,..,|({{,,,...,,|||.,,,.||{|,,|....,,|||||,,{{{{{{,.{{{|{|,|||{{{({...,,.,,((((({,((((((.........))))))(((((((.((.((.(({{,{({(({.{{,{..{,,.((({,,{,.|,,,,,(((((((.,,...((((((....))))))........,}.))))))),}|,,.|,.}},}},)}))),...,}}.,.))).))})..))))))}.(({......))).,.....}})}))),,}}.,,...)))))}..,.)))))),})}||||||||||}}}}||((((({{((((.((.(((.,{,(((((.......)))))..,.(((((...})))),}))))).)))}.}}).))))},|,.,{,|{,,,.}},,},,)))},,,}},.,..}.))))))).))))))..)),...((((...))))....)))).))))))))).......,,))))))))))))),..},,,,.....(((((....)))))...}}))...........((.((((.....)))).)).))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.