Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0008400
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0123945 hsa_circSMARCC1_087 hsa-SMARCC1_0135
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47680215-47727660 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47638725-47686170 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-328.1 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -349.64 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 258.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((....)))..(((((((((((((......))))).....(((.(((((((.......((.((((((..((((((((((...(((....(((((((.((((.....))))))))))))))...))))))))....))..))))))))(((((((((....((((.........))))...((((((((((((.(((((((((.........))))...(((.......))).......))))).))))))...((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((....(((.(((.((((.......)))).))).)))((.((((..((((((((.((.(((.(((...(((..((((.(((((....)))))........)))))))))).)))...)))))))).))..))))))..((((....))))..)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))...((((.........))))..(((((((((((((.(((((((((..................))))))..))).)))))).(((..((((.((.((.......)).)).))))..))).))))))))))))).....((((((((...((..(..((((............(((((((.((...((((((....))))))........)).)))))))))))..)..))))).))))))))))))))...))))))).)))))))))))...(((.....(((.((((((((..((((......((((.......))))..(((((((((((.((.((.(.((.((((...(((...(((((((((((....((.(((((....(((((((..(.(((((((..((.....)).)))).))).)..))))))).................))))).))....(((((((((...((((.......))))..))))))).)).))))))..))))))))))))))).)))))))))))))))))))..)).)))))).))).....)))..((.((((.....)))).))..)((....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..{{{....})),,{{{{{((((((((......))))},,,,,(((,((((({(.......{{.((((((..((((((((((.,.(({...,(((((((.((((.....))))))))))))))...)))))))),...))..))))))}}((((((((((((((((.....(((..((((.,.((((((((((((.(((((,,,{.........||||,,.{{{....,..))}.......))))).))))))...((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((,..,(((.(((.((((,,....,)))),))).)))|{.((((..((((((({,{{.{{{.(((...(({.,((((.(((((....)))))......,.)))))))))).}))...)})))))).))..))))}...((((....)))).,)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))...,((,.....,.,,||,,..(((((((((.{.,.(((((.((((,,(....((((((((...........))))))))))))},).)))))..,.}.}}.))))))).,,,,....))))))..,.))))..))).{{(,.{{{.||,{,.{,..,|||}.}}.)}}.}}|((((((.,,...((((((....))))))........,}.)))))))})}}}|||....,..}}}}))))))))))..,)}))))}.||||}}}}))),,.(((.....(((.((((((((..((((......((((.......))))..(((((((((((.((.((.(.((.((((.,,{{({(.{{((((((.,{....||,||{{{{,.,{((((((,,(.(({((((..((.,,..||,||}},.}},|,.}}}||||.{,||,,....}.,,,.}..))}})}.,}))},|{{{{,.,||||.,})),}},.}}|||||}||,||.}}})).,}}))})).,))))))).)))))))))))))))))))..)},)))))).))).....))).,||.{{||,....)))),))..){{....))
Forensic Context

No forensic context available.