ForensicRNA
Home
Atlas
Index
MH Mapper
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_SMARCC1_0013500
Basic Information
Symbol
hsa_SMARCC1_0013500
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0007198
hsa_circSMARCC1_097
hsa-SMARCC1_0011
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47712148-47719801
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47670658-47678311
UCSC (hg38)
External Database
circbank
circBase
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-114.8
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-123.93
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
71.68
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((.((.((.((((........)))))).)).))))(..........(((.(((((......((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((....(((.(((.((((.......)))).))).)))((.((((..((((((((.((.(((.(((...(((..((((.(((((....)))))........)))))))))).)))...)))))))).))..))))))..((((....))))..)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))...((((.........))))..(((((((((.(...(((((.(((((.(....((((((((...........)))))))))))).)).)))))....).)).)))))))....))))).))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((.((.((.((((........))))}}.)).))))(,{........(((.(((((......((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((,..,(((.(((.((((,,....,)))),))).)))|{.((((..((((((({,{{.{{{.(((...(({.,((((.(((((....)))))......,.)))))))))).}))...)})))))).))..))))}...((((....)))).,)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))...{(({.........}},,..(((((((((.{.,.(((((.((((,,(....((((((((...........))))))))))))},).)))))..,.}.}}.)))))))....))))).))).)
Forensic Context
No forensic context available.