Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0013700
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0123948 hsa_circSMARCC1_072 hsa-SMARCC1_0246
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47712148-47742892 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47670658-47701402 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-214.8 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -231.54 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.42
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((..((.....))..)))(.((((.((((.(((((..((((..........))))..((((((...(((.....))).(((((((...((...((((.(((((...)))))...........................(((......)))((((((.((......)).)))))).))))..)).))))).))..............((((((.................))))))...((.(((((......))))).))..))))))((((((((((((((..(.......)..)))))))))).))))((((((((.((((.....))))))))))))....(((((.........)))))))))).)))).)))).)..((((.........))))...((((((((((((.(((((((((.........))))...(((.......))).......))))).))))))...((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((....(((.(((.((((.......)))).))).)))((.((((..((((((((.((.(((.(((...(((..((((.(((((....)))))........)))))))))).)))...)))))))).))..))))))..((((....))))..)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))...((((.........))))..(((((((((.(...(((((.(((((.(....((((((((...........)))))))))))).)).)))))....).)).))))))).........))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,..(((..((.....))..))){.((((.((((.{((((.,{({(..........||||..{{,{||...{((.....))}.,.{((((,..,..,,|||,.(((((...})))).,......,,,...,,.......,.,.(((......))}(((((,.{{..,,..}}.}}}))).}}},..,}.})})).}}......{{{||{{{((((((...........,.....))))))..,(({(((((......))))}.,}.,))))}|((({((((((((((..(.......}..)))))))))).))))|(((((((.((((.....)))))))))))}....,,}}}}}}))..,.,}.),))))).)))).)))).}..((((.........)))).}.((((((((((((.(((((,,,{.........||||,,.{{{....,..))}.......))))).))))))...((((((((.(((.(((((((((((((.(((((((((,..{(((.(((.((((,,....,)))),))).)))|{.((((..((((((({,{{.{{{.(((...(({.,((((.(((((....)))))......,.)))))))))).})}...)})))))).))..))))}...((((....)))).,)))))))))......)))))))))).)))..)))))).)))))..(((((((..........)))))))...,{{,.....,,,,||,...(((((((((.{.,.(((((.(((({,(....((((((((...........))))))))))))},).)))))..,.}.)).))))))).,,,,....))))))
Forensic Context

No forensic context available.