Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0013900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0065268 hsa_circSMARCC1_031 hsa-SMARCC1_0324
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47712148-47787483 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47670658-47745993 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-411.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -440.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 450.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...)))(((..(((..((((.(((((((((((((((.(.......).)))))).))))...........(((((....(((((...(.((((((..(((((..((((((.....))))...))..))))).((((((....))))))....((((((((........))).)))))...)))))))..)))))...))))))))).).))))..(((((((.(((............(((.((.......)).)))..............((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.((((((((....(((.((.....)).)))..((((...................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..)))))))))))))(((....)))..(((.((.(....(((((((((.((((((.((((.......((((((...)))))).....))))..))))....))..)))))))))....).)).))))))))))).)))).))))))))......))))))...))).))))))))))).))))))).....((.((((((..(((.((.(((((((((..................((((((((((((..(((((((((....(((((((((.((((..(.((((...............)))).)..))).).))))((((((.......)))))).(((((((.((..............((.((((..........))))..)).(((...(((.....)))...))).....................)).))))))).....)))))..............(((......)))((((((.((......)).)))))).....((((((((((((.........)))...((((((.................))))))...((.(((((......))))).)).(((((((((.((((.(((((.(((((((..((((((((((...(((....(((((((.((((.....))))))))))))))...))))))))....))..)))))(((((((.....)))..)))).........(((((..............)))))((((.........))))..)).)))))...))))....))))))).))............)))))))))((((((((((..(.((.(((.((.(((...(((((((..(((((((((....)).))).))))..)))))))..))))).)))..)).)..))))...(((((....)))))...))))))...))))).))))...))))))))))))......))))))))).))...)))..)))))).)).....((((((.(((...(((((...((.....(((((((..........)))))))..)))))))...))))))))).(((((((((.(...(((((.(((((.(....((((((((...........)))))))))))).)).)))))....).)).))))))).......)))..)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({...|}}(((..(((..(({,.((((({(((((((((.{.......|.}))))).))},...,,|......,{{,...{((((({.,(,((({{{.,||{{{..{{||{{,,,..|||}.,.||.,}}|}}.((((((....})))))....,{{{{{(({{.,,,,,|,,..)))),}}))},,))..}))}).,.})))))}}}.}.}}}},{((({(((,(({.......,,...{{,.{{......,}}.,}}.,,......,....((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.(((((((({,..{{(.((.....}}.)}}..|,,{,.,................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..))))))))).{||{{{.,,..,,,,,{{.{{,|,...{{({{{{{({{{{{{,,((((.....,,{,||||.}}}}}}}}.,...))))}})))),,,.}},.,))})))})..,})}})...))))))))).)))).))))))))......))))))...))).))))))))})},)))))),..,..{{.{((((({||((.((.(((((((((..,.............,.((((((((((((..{(({(((((....{{{{{((((.((((..{.((((...............)))).}..))).).))))((((((.......)))))).(((((((.((.....{{.......{{.{(((..........))))..}}.,{{...(((.....)))...}||{{,.....,,},,........)).))))))).....})}},..,.......,.,.(((......)))(({{{{.((..,,..)}.}))))).,...((((((((({.{,......,,|||{,.((((((...........,.....))))))...{(,(((((......))))}.}},||(((((((.{(((,(((((,.{(((((..{({(((((({.|.|{|...{(((((((.((((.....))))))))))))}}...})))))))}...}}..)))))}||{{((({{{{,...((((.........))))}}}))},}},...,,.|||||{{,{,,,......,}}),,,}.}}})),,.))),....))))))).}}.....,,,....)))))))))((((((((((..(,((.(((.((.{((.,.(((((((..((({({{({....)).))},))))..))))))},.}}})}.)))..}),),.)))).,.(((((....)))))...))))))...))))).))))...)))))))))))).,.,..))))))))).)).,,}})}.)))))).)).....{(({{||(((.,.((({{.,.{|,,...(((((((..........)))))))..}})))))...))))))))).(((((((((.(.,.(((((.((((,.{....((((((({...........))))))))))))},}.)))))..,.,.}}.))))))).,,,...))).,)))
Forensic Context

No forensic context available.