Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0016100
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0065271 hsa_circSMARCC1_059 hsa-SMARCC1_0153
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47716965-47755980 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47675475-47714490 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-280 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -302.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 261.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((((......((((..(((((((.(((.((.((((((((((((((((.((((.......((((((...)))))).....))))..)))).((.(((.....))).))..))))).....((.((((...(((((((((((((((((((...)))))....)))))))...((.......))......(((((..(((.((.(((((((((..................((((((((((((..(((((((((....(((((((((.((((..(.((((...............)))).)..))).).))))((((((.......)))))).(((((((.((..............((.((((..........))))..)).(((...(((.....)))...))).....................)).))))))).....)))))..............(((......)))((((((.((......)).)))))).....((((((((((((.........)))...((((((.................))))))...((.(((((......))))).)).(((((((((.((((.(((((.(((((((..((((((((((...(((....(((((((.((((.....))))))))))))))...))))))))....))..)))))(((((((.....)))..)))).........(((((..............)))))((((.........))))..)).)))))...))))....))))))).))............)))))))))((((((((((..(.((.(((.((.(((...(((((((..(((((((((....)).))).))))..)))))))..))))).)))..)).)..))))...(((((....)))))...))))))...))))).))))...))))))))))))......))))))))).))...)))..)))))...)))))))...)))).))..((..((((((((...(((((((..........)))))))...)))..)))))..)).))))))).)).))).))))))))))))))))....)).)))(...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((.,.(((((,...,,|{({..,{(((((,(((.{{.((((((((((((((({.((((.....,,((({{{...})}})),....))))..)))).,,.{|{..,,}))),),..|||||,,,,,((.((((...(((((((((((((((((((...)))},..,})))))))...{,...,,..,,..,,.,((((({,{((.((.(((((((((................,.((((((((((((..(((((((((....{((((((((.((((..(.((((...............)))).)..))).).))))((((((.......)))))).(((((((.((.....{{.......({.((((..........))))..}}.,{{...(((.....)))...}||{{{.....,,,,,........)).))))))).....}}}},..........|,,.(((......)))(((({{.((......)).}))))).,...((((((((({,{,......,.|||,..((((((...........,.....))))))...{{.(((((......))))).}},{|(((((((.{(((.(((((..{(((((..((((((((((.,.{({...{(((((((.((((.....))))))))))))})...)))))))),...})..)))))}||{{((({,{{,...((((.........))))}))})},}},......,||||{{,{,,,......}}}),,,}.))})),,.)))}....))))))).}}...,.,,,....)))))))))((((((((((..(,((.(((.((.(((...(((((((..(((((((((....)).))),))))..)))))))..})))).)))..}),),.))))...(((((....)))))...))))))...))))).))))...))))))))))))......))))))))).))...)))}.))))),..)))))))...)))).)){{{{,.{,||,||,...(((((((..........)))))))..,||},,,,,,},,},.)}})))).}).)}}.})}))))))}))))))....))})))(...)
Forensic Context

No forensic context available.