Basic Information

Symbol
hsa_C3P1_0003500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-C3P1_0042
Host gene
C3P1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
19:10172485-10181763 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
19:10061809-10071087 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-262.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -276.47 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 186.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((((..((((((((((....(((.((((((.(((....(((((..(((...((((...(((((..((....))..))))))))).))).)))))........(((((......)))))..........))))))))).)))....))))...))))))((.......))(((..((((((((((....(((..(((((...))))).)))..))))))))))..))).((((((..(((((...((((.((..........)).))))..((...(((((((((((.......)))))..))))))..))((...((((......)))))).))))).....))))))...))))))))...(((((((((.....))))..)))))..............((((((.(.....).)).))))....(((.(((((...(((((((.((..((((((((((((.(((................((((.((((....)))).))))(..(((((......)))))...).......))).))).((((...)))).((((((..((((.....(((......)))....))))..)))))).......(((....))))))))))))((((........)))).......................(((((((((..((.(((....(((.......)))....))).))..))))))))).)).)))))))..))))).))).(((((.......)))))((((((...(((((.........)))))...)).)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.......((((((((,.{((({((,{{.,..(((,((({{{{(({...,(((((..(((...((((...{((((..((....))..))))))))).))).)))))........{{{{(,,,,..,}))),,........||}|||||}{||,{{{,||||{{{{,||||({........},)))}|,||||||||}}}},,|},|||||.}}},,||{|||..}|},,,||||.{|,..(((((,..,,,,,}}}||,|,||}}....}}}})).||||.{((...(((((((((((.......)))))..))))))..))},},}|||..,,.,,}})),}}))},).}}},)),,))...))))))))...(((((((({.....})))..)))))....,{,...,,..((((((.{.....,.)).))))....(((.(((((...(((((((.((..((((((((({{(((((................((((.((({....}))).)))),..(((((......)))))...,...,.}},)),}}}.{(({...}))}.((((((..((((.....(((......)))....))))..))))))......,||,...}),.)))))))))((((........||}}.............}},,..|,..(((((((({,(((.(((.,.,(({.......}}),,.,))).),,)))))))))).)).)))))))..))))).))),(((((.......)))))|(((((...(((((.........)))))...)).)))}.
Forensic Context

No forensic context available.