Basic Information

Symbol
hsa_CADPS2_0001300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0133190 hsa_circCADPS2_020 hsa-CADPS2_0004
Host gene
CADPS2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:121985628-122056218 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:122345574-122416164 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-286.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -309.79 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 406.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((((((((((((((((((((.....((((....))))...))))))))..((((((((.((.(((((.((......)))))).).))))))))))....))))......))))))))((((.........))))......((((((((((.(((((...........((((((.((((.(((.....((((.((((...(.((((((..(((((((.((((....(((((((...........(((((....))))).(((((....)))))..)))))))...........(((((..(((((((((((....(((((((...((...(((((.(((...)))...))))).)).)))))))...)))))))))))..))))).((((.((...)))))))))).)))).)))..)))))).)...)).))))))......))))))).)))))).....(((((.....)))))))))).)))))).)))).))))))((((.((((((((.((((.(((....)))))))............((((((((((.((((((((.(((...(((((((((((((...(((((.(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......)))))))))...((((...((((((...((...(((((((...((((....(((..(((((.......(((((((.......)).))))).......)))))..))))))))).)))))..))...))).....)))....))))..((((........))))(((((.(((((.((((.(((((((...((.(((((((((((((....(((..((((((((((.(((........)))))))))).))))))..)))))))).....))))).))..))))))...((((((..(((...((((((((.......))))))))...))).((((.....))))..))))))........).))).).)))))...)))))...))))).))))))))...........)))))...)))....)))).....)))).)))))))))).))))))))..))))..................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.((((({(,{((((((((,((((((((....,(((({,..,))),}.))))))))..((((((((.((.{((((.((......)))))},}.}))))))))){{{{{{||{{{.,,|||}||,|((((.........)))),..||.|||||{,,,,.(((((((({.....(((((........)))))....,|}}}|}}},....{{((({..{((((,{,,,,,,,.,,,||||..{(((((({..,,,,({({.(({.((((((({...,)))).{({{{{.|{{{||,,,.....((((((....,|}}}}}....{|{,.((((((...))))))..,,||)}}}.})))))......)))).}))...))))},))))))))},{{{{|({|,,}}}}}}.,}},}}}}})))..}))))),,...}},||}}}},,....}}}},,,.|||||}|,,...,{{|,,,.,}|}},,,,,,.,}}}}},|}}}.,,))))||||||{{{||{{.((((.(({....}))))))......,{{...(((((((((((((((((,(((((...((({,((((((((((({,,,,.(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......))))))))).,,.(((.{{{,,,,||{||...,|,.,,,,...})))),,}..}}),}}},...,,}}|||||||.......}}.}))))})}}},.)))))}}|{{{({,{{.{({{{..,(({{{....}}}||....,}))).,|{{,.,,,|,,,||}}{{{||.||||}}||||}||{,,(({..(({(((,.{(((((((....(((..((((((((((.(((.,....,.)))))))))).))))))..))))))))..{{.|||||{||{{||||},...((((((,.,((.{{((((((({......,}))))))),.,}}}.{(((.....))))..))))))....,}}}))))..,.))))),.,),,})})))),.}})||||||{.........}}}}))},,|}}....,},||{...,}})}.})))))))))..)))}}}},}))}},,}}...,,,,.},,,.,
Forensic Context

No forensic context available.