Basic Information

Symbol
hsa_CADPS2_0004500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0082080 hsa_circCADPS2_015
Host gene
CADPS2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:122019422-122111616 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:122379368-122471562 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-370.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -397.92 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 427.67
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((.......)))))..)(((((.....((((.((((((((((..((((...))))..)))((((...))))..(((((......))))).((((........))))....(((((((..(((((((....(((...(((((((..(((((((....((((((......).)))))))))..))).)))))))...)))...(..((.((((((((..((((.((((((((((.((....(((((...))))))))))....(((((.(((.................))))))))..((((((..(((....)))..))))))(((((((((((((((((((....))))...))))))))....(((.............))).....((.(((((...((((..((.....(((.((.(..((((((.((.((........................(((.........)))..(((((....(((((.((((.(((((((.(((((.(((((.(((....))).)).))).......((((.(((((((((((((((.((.(((((.((......)))))).).))))))))).)).)))))).))))))))).)))).)))(((......))).......(((((((((.....(((((........))))).....)))))))))....((((((........)))))).)))))))))..))))).....(((((....)))))........((((((.(((.....))).))))))..(((((..(((((((((((....(((((((...((...(((((.(((...)))...))))).)).)))))))...)))))))))))..))))).)))).)))))).).)).)))...))))))....)))))))..))))))).............)))))))...))))..)))))))).))..)........(((((......)))))...(((((.....((((.(((....)))))))........))))).........(((((((.(((((...((((.(((((((((((......(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......)))))))))....(((.(((..(.((((....((........))))))..)..))).)))....)))))))))))...........)))))))))..)))))))...((((.((....)).))))...)))))))...........)))))))..((((((.(((.....)).).)).))))..)))))))))))........(((......)))((((((((((.(((........)))))))))).))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((.......)))))..)(((((.,,,.((((.((((((((({.,((,({{{||||{{|||{{{{.,,}}}}..(((((......))))).((((........))))....((({(((({{{{,{{{....{{{.,.{|{||{{,,({{,,{,..,|||{|||,,,,..|,||}}|||,.,}})),}||||||,{{|||,.,{{.{{.((((((((..((((.(((((((.(({{....{(((((...}))))),.}||||,({,,,.{{{....{{,..{{{{{...,,|||,||{.,,,|||.,|||}}}}))},,)))}}}{((((({(((((({{{,{|}},,)}}}..,}}}}}}}|.,,,{(({{{{....,{{{..,......||}|{{|{.,}||||..,,..,||||{.((,{.,((((((,((.{{............,,,.,,......(((,,......,|||,.{{{{{....(({{,.{{{{.{{,{{,({((((({,{{{({(((((,..,,.||{{||..,}}}.|{||}|||||{{((((((((.((.{((((.((......)))))).}.)))))))))),}.}}))))})))))))),.}}},})))|{,....,,}}),,.....(((((((((.....(((((........))))).....)))))))))....,{{{,{..||||,,|}}}}},}})}}}}}}..|||||,,,..{{{{(,,,.|||,|,(({{{,...,)))}.{({{{,.||||||,,....{{(((,,({{{{{|||||,...,{{{,,({((((...))))}}.,|,||||},.,))))).,,.,,)))),,,,}}})))))))),,))))),}}}}.||}}}}.},)).})}.,.))}))).,,,)))))})..})))))).}},......,,,)))))))...))))..)))))))).))..,........(((((......))))).,.(((((.....((((.(({....}))))))........))))).....,,,(({{(((({(({({...{(({,((({{(((((((.{,,.(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......))))))))),{{.(((.,,|}}.,||||},..}},.}}}}...,))))}})..}))})))}.}}))))|||{(||.......}}.})))))))})},))}))))},,||||},,,{{,|..}|||,,.}},))))}....,,))}.,))))))..|(((((.(((.....)).).)),,))),.))))))))))}........|||.,,,,.}}}((((((((((.(((.,....,.)))))))))).))).)))))
Forensic Context

No forensic context available.