Basic Information

Symbol
hsa_CADPS2_0005200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CADPS2_0053
Host gene
CADPS2
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:122027080-122091529 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:122387026-122451475 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-297.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -319.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 332.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.....(((.((((((((.......(((((((.........((((((.....((((((.(((......))).)))))).....)))))).((((.((((((.....(((.(((....))).)))))))))).)))......((((((((((((((((((....))))...))))))))....(((.............))).....((.(((((...((((..((.....(((.((.(..((((((.((.((........................(((.........)))..(((((....(((((.((((.(((((((.(((((.(((((.(((....))).)).))).......((((.(((((((((((((((.((.(((((.((......)))))).).))))))))).)).)))))).))))))))).)))).)))(((......))).......(((((((((.....(((((........))))).....)))))))))....((((((........)))))).)))))))))..))))).....(((((....)))))........((((((.(((.....))).))))))..(((((..(((((((((((....(((((((...((...(((((.(((...)))...))))).)).)))))))...)))))))))))..))))).)))).)))))).).)).)))...))))))....)))))))..)))))))))))))..)))))))).)))))(((((..((((((((((............(((((......)))))...(((((.....((((.(((....)))))))........))))).........(((((((.(((((...((((.(((((((((((......(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......)))))))))....(((.(((..(.((((....((........))))))..)..))).)))....)))))))))))...........)))))))))..)))))))..(((.((((............)))))))(((......)))..((((........)))).)))..))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..,,,(((.((((((((.,.....(((((({........,((((((,,.,.{{{(((,(({..,}))))}.)))))}.....))}}}}.{(({.{(((((.....(((.(((....))).)))))))))},}}),,...{((((({((((((,,,,,|}}},)}}}..,}}}}}}}|,,,{((({{{{....,{{{..,......||}|,,|,.}}||||..,,..|||||{.{{.{..((((((.((.((............,,,..,......(((,.......,|||,.{{({{....(({{{.{({{.{{{{{{(,(((((,{{({({((({{,..,}.|||{||..,,}}.|{||,|||||{{((((((((.((.{((((.((......)))))).}.)))))))))),}.}})))),))))))))}.}}}}}}))|{{....,,}}),,.....(((((((((.....(((((........))))).....)))))))))....,,|,,,..,|||..}}},}},))))}))))..|||||,,...{{{{(,,,.|||}|,{{{{{,...|)))}.{{{{{,.||||}},,....{{(((..({{{{{{{{{|,...{{{({,({{(((...|}|||},,|,{|||},.,))))).,,.}})))),.,,}}})))))))),,))))).)))).)))))),|,}}.}}}...})}}},,},,))))))}..)))))))))))))..)))))))}.))}))(((((..((((((({{{............(((((......))))).,.(((((.....((((.(({....}))))))........)))))........{(((((((.(((((...{(((,((((((((((({.,...(((((((((....(((..(((((.(........).)))))..))).......))))))))),,,.(((.{,|}},,|||||,..}},.}},,...,)))),})..})),))),.,,})))|||||||.......,}.})))))))}}}.)))))))|.,{(,{{{,,{{{{...{{{{|,,,.}}|||....,,)))..((((........)))).}}),,))))))).)))))
Forensic Context

No forensic context available.