Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0026400
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0065291 hsa_circSMARCC1_029 hsa-SMARCC1_0056
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47742768-47787483 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47701278-47745993 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-204.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -220.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 245.02
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..((((((((.((((((((...(((((.((((.....)))).(((((((((..(((((..(((((.....(((((....(((((...(.((((((..(((((..((((((.....))))...))..))))).((((((....))))))....((((((((........))).)))))...)))))))..)))))...)))))....)).))).(((((.((((...........................)))).)))))...........((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.((((((((....(((.((.....)).)))..((((...................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..)))))))))))))(((....)))..(((.((.(....(((((((((.((((((.((((.......((((((...)))))).....))))..))))....))..)))))))))....).)).))))))))))).)))).))))))))......))))))...))).))))))))))))).......))))))))).....)))))..)))))))).................(((....)))....(((....))))))))))).))((((.((((..(.((((...............)))).)..))).).))).((((((.......)))))).(((((((.((..............((.((((..........))))..)).(((...(((.....)))...))).....................)).))))))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..{(((((((.((((((((...(((((.(((|.....}))).(((((((((,{(((({....,}|,.......,..,.(((((((.,{{(((,,,,}||,|,..,{||||}}},,||||.,,||,,|||||.((((((....})))))....,,,,,{((((.{{{{,{....))))})))),..}}..|||||.|,||}}}|,.,,,..,,.|{(((,((({(({.......,,...{{,.{|......,)},,}}.|,...........((((((((.(((...((((((.....((((((((((((.(((((((({,..{{(.((.....}}.))}..|,,{,.,................(((((((((..((.(((((.......)))))...))..))))))))).{||({{.,,..,,,,,{{.{{,|,...{(({{{{{({{{{{{,,((((.....,,{,||||.,}}}}}}}.,...))))}})))),,,.}}..,))})))})..,})}})...))))))))).)))).))))))))......))))))...))).))))))))})},)))}}},.))))))))).....)))))..)))))))}.................(((....)))..,.(((....)))}}},},}}.{{((({.{{((((.(((,....{{...........)).....))).)))),},|||||.......))||||.{(((({(.{{....,||.....,,||.{{{|,.........}))}..}}.,{|...{((.....)))...})}||,.....}}}},...,.,,.)).))))))).,}}.)
Forensic Context

No forensic context available.