Basic Information

Symbol
hsa_CADPS2_0017100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CADPS2_0117
Host gene
CADPS2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
7:122254683-122304086 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:122614629-122664032 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-444.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -481.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 515.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((.(((((((.((..((((((((((((((((..((...((..(.((((((((((((......)))....))))))))).).)).))..))))))))...(((((........)))))..(((((((((((((((((((......))))((((...))))....))))....((((((((........(((....(((((((((..((((.....(((((((((......)))).....))))).....))))))))))))))))........))))))))((((((.((((((.(....((((....)))).(((((((((((((..((((((.((((((.(((..(((((((.................(((((...((((...(((((((((((.(((((........)))))((((....)))).......................))))))))))).....)))).)))))..))))))).))).)))))).))))))((((((((((((..(((..(((((...)))))..))).......((((........))))((((((((((......((((((((.(((((.((.(.....).))..)))))(((....)))........))))))))(((((.......((((((((((.....((((.......)))).....)))))).)))).......))))).....((((((..((...))..)))))).))))))))))(((........)))))))))))..)))))))))))))))))(((.(((.......))).)))....((((((...(((((........)))))....))))))(((((((........(((....((((......)))))))......(((((((.....((((((...((((...........)))).)))))).....)))))))...)))))))(((((....))))).........).)))))).)))))).....................)).)))))))))....))))))))...(((..(((.(.(((...)))..).)))...)))..(.((((.(((((.....((((.(..(((.(((...))).))).)))))..((((((...((.((.(((.....(((((.......))))).....))).)).))....))))))))))))))).))).))))))).))((.(((((((..((.((.....)).))..))))))).)).....((((((((.........))))))))((((((((..(((.........(((((((((...........(((((((.(((((((.....((.(((...(((((.((((.((..(((((.(((((((((.((((((.(((((((((((.(((((((((.....))))..........)))))..)))))..(((....)))..(((........)))..........)))))))))))))))..)))))).......((((((((((((((((((...)))))))))))..........((((((...))))))((((((((.(...........).))))))))......)))))))........)))))..)).)))))))))...(((.((....)).)))))))))))))))..)))))))..........))))))))))))..))))))))......((((.((((((....(((((....)))))...)))))).))))...........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,((.(((((((.((..((((((({((((((((..((.,.....(.((((((((((((......))),...})))))))).).}..))..)))))))}...{{{((,,,,,,,,))}}}.,((((((((((({{{{((((......))))|,.,....|||,{,{,||.,{{.(({,,.|}}}}.}}.}|||.}}|(((((((((({((((...,{((({,((((......)))),,,}}},,))},...,}))))))))))).,.,{{{{,..,||}}}},{(((((.((((({.(,,,.((((....}}}}.((((({{{{{{{{.{{{((((.({{{{(.{((,,((((((({{{{{,,,{{{,{{{{.{{((({{{.{{{..|({{{{{((((..(((((........)))))...,,}},,,{{{{{,,{|{,..,,,,,,,.,,,,|||||}}}}}|{{{.|||,..,))),},)))))}},})).)))))},))))}||(((((({((((||{((..(((((...)))))..))}......|(({,.......})})}{{{{{{{{((|,....((((((((.(((((.,{.,.....,.))..))))){((....)))........))))))}}(((((,{,,...((((((((((.....((((.......)))).....)))))).))))...,},.))))).,,,.{|||||..||,,,}},.)))))),))}}))}}}|{,{........||||||||}}|,,|||.|||||}}||||||(((.(((.......))).}),....((((((...((((,.,{....})))))....)))))).,(((,({.......||,}},.((((......))))|||.{{{{.{{{{{{,,,,,.|||{{{.,,||||,,|,,,.,},,))}},)})))),,...))))))},,}}))}}}|{{(({....}))))}}},|..,,,,)))))).)))))}...,,.....,.}},,...,}}}.))))))))).,..})))))))...(((..(((.{.(({...)))..}.))}...)))..(.((((.(((({...,.{{{{.|,.,{{,||,,,.,}}.,}}.}}}}),|((((((...{{.((.(((.,...(((((.......))))).,,..))).}},}}....)))))}))))))))).))).))))))).,)|{.(((((((..((.((.....)).))..))))))).)}....|((((((({.........))))))))|(((((((..(((,,.......{((((((((.,.....,...(((((((.(((((((..,,,,{,{{{,..(((({{((((.,{,.(((((.(((((((((.((((((.{(((((,((({.{(((((({{.....}|||.........,)))}}..))))}..(((....)))..(((........)))..........)))))}))))))))),.})))}}.......((((((((((((((((({...})))))))))}..........((({{{...))}}}}((((((((.{...........).)))))))).....,))))))).,...,..)))))..}}.)))))))))...|||.||....},.}})))),,)))))))..)))))))...}....,.))))))))))))..)))))))}......((({.((((((..,,{((((....)))))},.)))))).})))...,.......
Forensic Context

No forensic context available.