Basic Information

Symbol
hsa_CADPS2_0019300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CADPS2_0163
Host gene
CADPS2
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
7:122375018-122377122 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:122734964-122737068 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-513.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -554.98 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 601.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((.....(((((((((((..(((..(((.((((...))))))).))).((((....)))))))))))))))..(((((.....((((.((..((((((.(((((....))))).))))))..)).)))).....)))))..(((((.((((((((((.(((.............((((((((........))))))))((.(((.(.((((.....)))).)))).))))))))))))))))))))((((((((((((((((((((((...(((..........)))((((((((((((((..............(((((((((..((...(((((....((((...))))......))))).))..)))))))))..(((((....)))))...((((((........))))))............(((((((..........(((((((........))))))).(((..(((.((((((.......))))))))).)))...(((((((((.(((((((......((((((.....))))))....(((((((((.(.(((((((((((..((....))..).)))..(((.((((((((((.(((.....))).)))))))))))))((((((((((.(..((((((((((.(((..((((......))))))).))))))(((((..((((.....((((....))))....))))..)))))(((((((((.....)))))).((((......(((((((....(((((((..((..(((((((......)))))))..))...............(((((((.(((((((((((((...(((..(((.((..(.(((((((((((................((((....((((...((((.(((...((((.((((.....(((.((((.(((((((((..(((((......(((((((.((..((((((((((((((..(((((((((.......(((((((((.((((((...(((((.....)))))(((((((.(((....((((((..((((....))))(((((...(((...)))..)))))...(((((........)))))..))))))..))).)))))))............))))))...)))))))))((((..((((((..(((((((((..(((((((....)))))))..)))(((((((.((((((...((((((....(((...........)))...))))))))).))))))))))((((....)))).............))))))..))))))..))))..))))))))).......)))))...........((((((...(((((..........((((.....))))..))))).)))))))))).))))))).)))))))......)))))))))))))))))).))).....)))).))))...))).))))......))))....))))..(((((((((..............))).))))))(((((........).))))......((((((.....)))))).))))))))))).)..)).)))..)))...))).....)))))))))))))))))((((((...))))))...((.((((..................)))).))......((...((((((..((((((.((.......((((.....)))).)).))))))))))))...))...)))))))...)))))))..))))..)))..............))))..)))))))))))...(((((...(((.(((((.(((.........))).))))).))).)))))....)))))))).))))..))))).........(((((.((((.((((..((((.(((....))).))))....)))))))).))))).(((((((.(((..(((((...)))))..))))))).)))))))))).)))))))))....)))))))...)))))))))))))))))))))))))...)))))))....))))....)).))))((((((......))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.({.....((((((((((({{((..{(((.((({...|)))|||{|||.{(((....)))}|||||||||||,,(((((.....((((.((..((((((.(((((....))))).))))))..)).)))).....))))).,(((((.((((((((((.((,.....,.....,,{(((((((........)))))))|((.{{{.{.((((.....)))).}}},.)))})))))))))))))))))|}||||,,,,,,{|||||||,...|{{.,,,..,.,.,|,((((((((((,,,.........,}}}},|||||{,{{..{{.,,|||||},.,,....,.,}},,.....}})))),,}}))))))),,.}{(((|....})))}.,,{(((({{({{{..,,|||,,..{{{{......,,.,)))}.....,|,.{((((((........))))))).{{{..((,{((((((.......))))))))).,,,...,((((((((.(((((((....,.((((((.....))))))....(((((((((.,.(((((((((((..((....))..}.)))..(((.((((((((((.(((.....))).)))))))))))))((((((((((.(..(((({((({{,(((,.((((,,,,..}}|||||.}}}))},,,{,,||||||||,.((((....)))}.,{{((,{,.|||||(((({....})))}}}|,,|,{{{{{((,.,,{((((({,,{{((({,,..{({.(((((({......}}}}}}}..||...............(((((({,(((((((((((((...(((.,{{({{,..{.((((((((({{......,||||...,..,,,..,,{{((.,,{(((.(((...((((.{(((.....(((.((((.(((((((((..(((((......(((((((.((..(((((((((,,(({,.(((((((((,.,...{(((((((((.((((((...{((((.....))))|{((((((.(((..,,(((((,..((((....)))){((({.,.{({...}}}..}}))).,,{{{{|,........,,,...,)))))..))).))))))),.....,,,,..))))))...)))))))))|{{{..{{{(({,,{|{,{||{{..{((((((....})))))}..}}|(((((((.({((((...((({,{....{{,....,,,,,..,}}...)))))})))},)})))))))|{{{....)))).||||,,......)))),}..}}}}}}..}}),..||||||||}..,,,,.},,,,.,,,,...},.||||||.,,{{{{{..,.....||{{||...,,)),,..))))),))))}})))).))))))).)))))))......)))))))))))))))))).))).....)))}.))))...))).)))},.,...}}}}.,}.}}}}..{((((((((..............))).)))))|{{{{|.,....,.}.})}},.....((((((.....)))))).}}}}})))))).}..))}}}},,})),,,))).....)))))))))))))))))((((({...}))))),},{{.((((..................)))).}}.,,||.||,..||||||}}|,{{{{|||.,,,,|.,|||.....)))}}))|))))),})))))}}.}}.,,}}}}}}}}}|}}}))}|..,})},},}}}.||||....,,..))))},}))))))))))...(((((...{((.(((((.,({.........}}}.))))).))).)))))....))))))),.))))..))))).........(((((.((((,((((..{(((.({|....})),))),....))}})))).))))).((({{(|{(((..(((({...)))))..)))))),.)))))))))).))))))))|{{..((((..|((((({...))))))}.))))..))),...,))))),)}},,.}},....)).))))((((((......))))))
Forensic Context

No forensic context available.