Basic Information

Symbol
hsa_CCDC66_0000400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CCDC66_0120
Host gene
CCDC66
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
3:56592874-56606456 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:56558846-56572428 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-509.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -552.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 489.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((......(((((((.((((((((((((.(((.....))).(((..((((.((.((((....(((.((((.....)))).)))....)))))))))).))).....(((((((((((((................)))))((((((.....(((.(((((...))))).)))))))))......))))))))......)))).))))))))..........((((.((((((((((((((((((.(((......((((.....))))((((.((.((...)).)).))))(.(((((.(((.(((((((((.......(((((((((..........)))))...((((((.................))))))(((((((...(((..((((((((.((((((((.(((((.............)))))))))))))...(((((((((..(((.....((((((......((........)).....))))))((((((.(........).))))))..((((..............((((((((((.((((.((((....(((((....((((((((.((((.(((...............))).)))).))))))))......)))))....))))))))(((((.(((.(((.(.((((((.((...........((((....))))(((((((..((((((((.(((((((((.....))))(((((.(((((.((((((((.........)))).((((..((.......)))))).((((((....(((.((.....((((.((((((((((.((((((((......))))).......(((....)))(((((.....)))))..........((((((((((.............((((..((......))..)))).......(((((.................))))).))))))))))....))).))))))))))...(((((((((((....)))))))))))...((((..((...((((..(((.(((.(((..(((((((((.........)).)))))))..)))..)))....))).)))).))..)))).))))((((((...(((((((((((((.(((.((((..........((((((...........((((((.....(((.((((.....)))))))))))))...........))))))...(((((((..((((((((.........))).))))))))))))((((((......))))))...........((((((((((.........)))))))))))))).))))))............((.((((((((...)))))))).)).(((((((...((((.((.((.........(((((.(((((..........)).))).))))))))).)))).)))))))......(((((((.....((((((.....)))).)).)))))))..(((((((....)))))))(((((...))))).))).)))))))))))))..((((......)))).)).)))..))))))..))))..))))).)))))((((.....(((.((((((((((.......))))))))))..))).......))))(((((..(((...)))..))))).....))))).))))))))..))))))))).)))))).).)))))))))))))))))))))((((((.((((........))))))))))(((((..(((((.........)))))...)).)))(((((((..((((((.......))))))))))))))))).)))..))))))))).....))))))))..)))....)))))))))))....)))))))))..)))))))).)....))).)))))))).))))))).))).)))).....)))))))...))))).((((((..((((((((((.(((((.((((......)))).)).))).))))).).))))...))))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((..,.,.(((((({.((((((((((((.(((.....))).(((..((((.((.((((....(((.((((.....)))).)))....)))))))))).))).....((((((({(((((................)))))((((((.....(((.(((((...))))).)))))))))......})))))))......))))},)))))))..........((((.((((((((((((((((((.(({....,,|(((.....)))|((((.((.{,...}|,||,||||{.{{{{(,({,.{{{{{{{{{,,,,,,.||,,(((((..........)))))...((((((.................)))))){(((,,{.,,{{|||{(((({{{.((((((((.(((((.............))))))))))))),,.(((((((((,.{((....,(({(({,,.,{{((,,......,}.....,,,|||((((((,(.....,,.,.))))))}.(((,....}}}......,||{{((((((.((((.((((....(((((....((((((((.((((.(((..{{........,..))}.)))).))))))))......)))))....)))))))){{{|{{((,{(((.(.((((((.((..{{,.,{((.((({....})))||||,((,,((((((((.(((((((({.....||||(((((.(((((..((((,,,..,,.....,}}},{(((..((.......))})}|.((((((....(((.{{,{..,{{{{,((((({(({(.{{,{{{{,......||}}}.......(({....})){{{{{.....}}}||,,,,||,...(((((((({,.......,,....{((({.((......)),})))}.......{{{{{..........,,,,,..}})))}})))))))))....,}},))))))})}}...{{(((((((({....))))))))))),.,((((..((...((((..(((.,((.,((..(((((((((.........)).)))))))..}},.,)},,,..))).)))).))..)))).||,|{{((({...((((((({,({....{{{({,{.,,,,,,...((((((...........((((((.....(((.((((.....)))))))))))))...........))))))...(((((((..(((((((({......},))).))))))))))))((((((.,....}}}))},{{{{,.,,,,(((((((,,,.{{,,,...,}}}}},,,,))))},,,)|||||||,,,,,,,||,{(((((((...)))))))}.}}.(((((((...((((.((.((.........(((((.(((((..,.....,.)).))).)))))))}),)))).)))))))......{((((((,....,,((((.....)))).}},)}))))}..(((((({....}))))))(((((...))))).)),.)))))))))))))|.|{{{.....,)))),)),)))..)))))),.))))..))))).)))))})))}},..|}}}((((((((((.......))))))))))..,.........,|{.(((((..(({...}))..)))))},...))))).))))))},,,)))))),)).)))))).).))))))))}}}}}}}}|||}}(((((({((((........)))))))))){{{{{..{(({{.........))))}.,.))}}}}(((((((,.{(((((.,....,)))))))))))))})},.)))}.)))))))))}).,.)))))))}.........})))))))))},,..,))))}))),,||{|||||...}}})))})))))))).))))))).))).)))).,...)))))))..,))))).,(((((..((((((((((.(((((.((((......)))).))}})).))))).).))))...)))))...,.,
Forensic Context

No forensic context available.