Basic Information

Symbol
hsa_SMARCC1_0031100
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0065296 hsa_circSMARCC1_013 hsa-SMARCC1_0020
Host gene
SMARCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:47755905-47814426 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:47714415-47772936 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-147.6 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -159.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 122.23
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((....(((((....(((...((((((((((((((.(((((..(((((((((.(((....(((......)))))))))))).)))))))).)))))))...................)))))))..)))..........((..(((((((((.(.......).)))))).)))..)))))))....)))))))(((((((..(((((...)))).).....)))))))...((((((.((((.....((((((....))))))....((((((((........))).)))))...(((...(((((((((((((((((..........(((((.((((...........................)))).)))))..........)))))))..........(((..((((...((((.((((..(((((.((.......)).))))))))).))))...))))..)))......((..(((((((((..((.(((((.......)))))...))..)))))))))..))....)))..)))))))...)))..))))..))))))....(((((.........))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((..,.({{{{,,..(({...{(((((((((((((.(((((..(((((((({{(((....(((......)))))))))))).)))))))).)))))))...............,...))))))}.,)))........,,({.{(((((((((.{.......}.)))))).))),.),)))}}....)))))))(((((((.,{((((...}))).}.,...)))))))...{(((((.{{(({{...((((({....})))))....,,||||{({{.{,,,,|....)))),}}||{...(((((((,,,(((((((..,.......(((((.((((..........{................)))).)))))..........))))))|,{{{.....}||||.((((...((((.(({,.{(((((.((.......)).))))))))).)))}...))))..,,,....,.{{..(((((((((..((.(((((.......)))))...))..)))))))))..)),...,,,..)))))))...}}}..,,,,..))))))....{((((,......,.))))).
Forensic Context

No forensic context available.