Basic Information

Symbol
hsa_CCDC66_0005600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CCDC66_0081
Host gene
CCDC66
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:56600622-56649300 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:56566594-56615272 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-267.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -293.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 308.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((....((((((((.(((...((((...(((..(((((....((((((((.((((.(((...............))).)))).))))))))......))))).........((((((...(((...))).))))))......(..((((.((((....))))))))..)......(((...)))(((((.....))))).((((((((....((((.((((((((((.((((((((..((.......))))))))))...(((((((((((......((((((((..(((........((.((.(((((........)))))..)).))........))).)))))))).........(((..((............))..)))))))).))))))......)))))))))).)))).((((((((((.(((((.((((......)))).)).))).))))).).))))......))))))))...(((((((((..((.....))...)))))))))......)))))))....))).))))))))....(((.....)))........(((((((.((...........)).)..............((((((.((...(..(((.....)))..)...)).))))))...........))))))((((((((....(((.(((((((((((((................)))))...(((((((((((((((((...))))))((((((....)))))).((((....))))...(((((........)))))..(((((...))))).((.((((((....(((....))).....))))))))..................(((((((((((((....((((((((((.......((((.(((((..........................))))).)))).....))))))...))))..)))).....)))))))))...........(((((((..(........)..)))).)))..(((......)))..)))))))))))..((((((.......))))))...............((((....((((...((....))...))))....)))))))....))))))))....))))))))......)))((...(((((......((((..((((.((.................)).)))).....)))).....))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{({........,.,,(((((((((.((((....(((((....((((((((.((((.(((..{{........,..))}.)))).))))))))......)))))....)))))))).))))}))}.((((((((..,,,,{,..{,,((((.((({....}))))))}..|...,..{{{...|||(((((.....))))).{{{||{{{....((((.(((((((((({((((((((..((.......))))))))},.{,(((((((((((...,,{((((((((..{{{....,...,..{,.{||||}.......|||,,..})}}}........))).}}))}))}.........{({........},,....,))}.,},)))))}})))))}..,}.)))))))))).)))).{{{{{(((((.{{(((.((({.,,,,,|}}|,|},|}}.,}}}}.},}}|||||||.}|||||||,..(((((((((..((.....}),..))))))))).........,{{{,...,....{{{{({{,,{{{{{,....,|}........{{{{{{{,||...........,|{|,.....,,......{{{{((.(({..(..(((.....)))..)..,}).)))))),||..,...}}})),}}}}}}}}}}},,}}}|.|||})))}||||{},.............,)))}},..(((((((((((((((((...)))))}((((((....)))))).((((....}))}...(((((.,....,.)))))..(((((...))))).((.{(((((...,(((....))).}.,.))))))))......,.......,...((((((((((({{.,..((((((((((.......((((.(((((........,........}........))))).))))..,..))))))...))))..)}},...,,,))))))))...........(((((((..(........}..)))).)))..(((......))).,)))))))))))..((((((.......))))))...............((((,...((((,.,((,...},...}}}},,,,||||.,....{||.,,,,}}}}.}}}}})))).,.,.,.},.................,{{{,...}}}}......,}}).}}}},..)))))}})))),}}}....))))))))
Forensic Context

No forensic context available.