Basic Information

Symbol
hsa_CCDC66_0006600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CCDC66_0104
Host gene
CCDC66
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:56600978-56649300 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:56566950-56615272 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-229.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -252.82 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 279.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((.....((((((((....(((..((.((((......((((.((((((((((.((((((((..((.......))))))))))...(((((((((((......((((((((..(((........((.((.(((((........)))))..)).))........))).)))))))).........(((..((............))..)))))))).))))))......)))))))))).))))....))))))..)))..)))..)))))......))))))..(((.(((..(((((((..((((((((..(((((((((..((.....))...)))))))))...........(((........((((((.....(((.....)))........(((((((.((...........)).)..............((((((.((...(..(((.....)))..)...)).))))))...........))))))((((((((....(((.(((((((((((((................)))))...(((((((((((((((((...))))))((((((....)))))).((((....))))...(((((........)))))..(((((...))))).((.((((((....(((....))).....))))))))..................(((((((((((((....((((((((((.......((((.(((((..........................))))).)))).....))))))...))))..)))).....)))))))))...........(((((((..(........)..)))).)))..(((......)))..)))))))))))..((((((.......))))))...............((((....((((...((....))...))))....)))))))....))))))))....)))))))).........................)))))).......)))................)))))))))))))))....))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{,{,{{{..{(,...|{{(((((.....))))}.{{((((,,....((((.(((((((((({((((((((..((.......))))))))},.{,(((((((((((...,,{((((((((..{{{....,...,..{,.{||||}.......|||,,..})}}}........))).}}))}))}.........{({........},,....,))}.,},)))))}})))))}..,}.)))))))))).}))).,.,||||||,.|||{{.{{{{,||||.|,}|,)}}}},..|||.{|{}}|{{||||.}||{{{{{{..(((((((((..((.....}),..)))))))))..........{{{{...,....{{(((({,,{{{{{,....,||........{{{{,{{.||............|,|,.....,,......{(({((.(({..(..(((.....)))..)..,}).)))))),||..,...,,})),}}}}}}}}}}},,}}}},}}|})))}||({{,,..............}})}},..(((((((((((((((((...)))))}((((((....)))))).((((....}))}...(((((.,....,.)))))..(((((...))))).((.{(((((...,(((....))).}.,.))))))))......,.......,...((((((((((({{.,..((((((((((.......((((.(((((........,........}........))))).))))..,..))))))...))))..)}},...,,,))))))))...........(((((((..(........}..)))).)))..(((......))).,)))))))))))..((((((.......))))))...............((((....((((..,((,...},...}}}},,,.||||.,....|||,},,,}}}}.}}}}})))).,.,,,.},.......,.........,{{{{...,||},.,....}}}.,,,,...)))))}}}))))}},....)))}))),
Forensic Context

No forensic context available.