Basic Information

Symbol
hsa_CCDC66_0006800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CCDC66_0060
Host gene
CCDC66
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
3:56601354-56603898 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:56567326-56569870 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-799.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -846.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 541.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((((.((((((((((((((.(((((((((((((.((..(((.(((((((((((((((.(((((((..(((...........((.((((.....(((((((((.(((((........))))).)))).)))))....)))).)).....((((..((....(((..((((((((.(.....)...))))))))..))).))..))))..((((((((.((((((.........(((((((...(((....(((.(((.((((((((..((((......((((....)))).....))))....)))..)))))..))).)))....)))...)))))))........)))))).)))))))))))..)))))))))))))))))))))).)))..)).))))).)))))))).)))))))))))))).))))))))))))(((((..(((((((((...........(((((.......(((((...))))).....)))))...........))))))....(((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((.((((.((((((.((((.((((.((((((.(((((.(((((.((((.((.(((((.((((((((((.((((((((...((((((((((...(((((((((.((((((......((((((.((((((......(((.(((..((((((((((((((.((((.............(((((...(((((((((((((.((.........)).)).))))....((((((((((...((((((((.....(((((....))))).))))))))...))).....))))))).(((.(((..(((((....))))).))).)))..(((((((((((.............(((((((((.......)))))))))((((((....((((((.((.......)).))))))))))))...(((((((((.(((((((.........))))))).((((..((..((((......))))...)).....))))....))))))))))))))))))))...((((..(..((((((((..........))))))))..)..))))(((((((.(((((.....)))))...))).))))((((((....))))))...)))))))))))).))))..)))))).))))))))..))))))............))).)))))))))(((((...(((....)))(((((((((.(((((..(((((........)))))......))))))))))))))..)))))((((.(((((.((((.(.((((((.........((((((.(((((((((((((((...................))))))))....((((((......))))))......(((((((.((((.((((.....))))..)))).).)))))).(((.(((((((((.........))))))))))))...)))))))..))))))..(((((((((((.........((((((......))))))..((((..(((((............)))))))))......)))))))))))....)))))).))))).))))).))))((((((((.((.(((....))).))........))))))))))))))...)))))))))........................(((.......)))).))))))))).)))))))).)))))))))).))))).)).)))).)))))...))))).)))))).)))).)))).)))).....)))))).))))))))))).)))))))))))).)))))))))((((((((((((...(((((((..((((((((...(((.((.(((((((((((...(((((.((....)).)))))..(((((((.......((((((.....)))))).......))))))))))))))).))).)).)))..))))))))((((.((((((....))))))..))))....)))))))..(((((..(((.((((((((((.((((((((...........))))))))..))))...........(((.((......)).)))((((.((((((...........(((((....(((((((.....)))))))....))))))).)))))))).............))))))..))))))))((((....))))...(((.((((((...)))))).)))((((.(((((..((((.(((((..(((.(((.........................))))))...))))).(((((..((((((..((.((((((((((((((.................))))))..................))))))))...))....)))))).))))).......)))).....((((......)))).....))))).))))....))))))))))))...........)))..))))).........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{(((((((((((.(((((({(((((((.(((((((((((((.((..(((.(((((((((((((((.((((((({{((,...........{(.{(((.,,..(((((((((.(((((........))))).)))).)))))..},}))).,}...,,{(((..({....(((..((((((((.,.....}...))))))))..))).))..)))}..{(((((((.((((((.........(((((((...(((....(((.(((.((((({(,..{{,.{{,...((((....))))...,.)),,....),,,.}))))..))).)))....)))...)))))))........)))))).)))))))))))}}))})))}))))))))))))))).)))..)).)))))}}))))))).)))))))})))))).)))))))))))|(((((..((({(((((.....,.....(((((.,{,.,,(({{{..,))))).....}|}}}...........)))))),,..{((((((((.(((((.(((((((.(((((((((((.((((,((((((.((((.((((.((((((.(((((,(((((.((({.((.(((((.((((((((((.((((((((...((((((((({...(((((((((.((((((......((((((.((((((......(((.(((..((((((((((((((.((((...,.......,.(((((...(((((((((((((.((......,|.)).)).)))},,},(((((({{{{...((((((({.....(((({....})))).})))))))...))|.....))}}))),,{{.{((,.(((({....})))).}}),)}}..(((((((((({,........,,..(((((((((.......)))))))))((((((,...{(({((.{{.......)).)}}}}))))))).,.(((((((((.(((((((.......,.))))))),(({{..,,,,{({(......}}}}...}},....))))....)))))))))})))))))))),|,|{,,..,..,(({{(((,{{,,.,||,}}}}}})),.},,)))}|,|}|,,.{((((.....))))),..,,|,|{{.((((((....)))))).,,}.)))))))))).))))..)))))).))))))))..))))))............))).)))))))))(((((...{{{....})|((((((((({(((((..(((((........)))))......)))))))))))))),.)))))((((.(((((.(((,{(.((((((.,.......((((((.(((((((,,,,.,,..............,{{,...)})},{{{{{{((((((......))))},,}).})))}.{{,,((({.((((.....)))),.)}))......((({,{,.(((((((((.........))))))))),,)))))))))))..))))))..(((((((((((.........{,,,((,,....,,}}))},((((,.{((((...,,.....,.)))))))))...,..)))))))))))....}))))).))))).))))).))))((((((((....{((....,}}{|{,...,}},))))))))))))))...)))))))))........,{,.............(((.......)))}.))))))))).)))))))).)))))))))).))))).)).}))).))))),..))))).)))))).)))).)))).)))),,...}})))).))))))))))).)))))))})))).))))))))}{{{{||||,{{{,,|{(((({,..((((((((...(((.((.(((((((((({...(((((.((....)).)))))..{{{{{{{.......{{{{{,...,,|}}}}}.},,,..)))}}}}}))))))).))}.)).))},.))))))))((((.((((((....))))))..))))..{{{|||||,..(((((..(((.{(((((((((.((((((((.,.......}.))))))))..))))...........,{{,((,,.{{{},.,},||||,|||{{{...........(((((..,.(((((((.....))))))).,..))))),,.}))))}|}|.......,...,))))))..)))))))){((,....))))}..(((.((((({...}))))).))),||(|{......}}}...,{,,.,{.,.,,|}}},|||{{{{{({{{{,{{{{{{{{||,{|,|{,,|,|,,||{,,|||||||,{,|,|{((((((,{,,}},}}},...,|||,,,,,,..,|||,...{{{{{|,|{{{{.,,,,},,,..,},.....,.}}}|}}}}|||,||||}|,|,...,,|{{|,,,||}}||,.,.,,}}))}})}}..)))))))))))))).))))))}}},)))..)))))}........
Forensic Context

No forensic context available.