Basic Information

Symbol
hsa_chr3_0745600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CCDC66_0115
Host gene
CCDC66
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
3:56646405-56647921 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:56612377-56613893 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-442.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -467.60 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 304.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((..((((..(((.(((((((.(.....((.(((((((.((.......))..))))))).))...)))))))).)))..((((((...))))))..........(((((((.((((.........(((.(((......)))))))))).)))))))....((((((.......))))))......((.((((...........((((((.((..((.((((..((((((((((((((((((...((((..((((.((((((....((((.((..(((((((((((.((((((.(((((....((((((((...((.(((.......((.((((.................))))..))........))).))))))))))..)).))).))))))(((((.....)))))..............(((((........)))))...)))))......))))))..))))))..)))).))..))))))))...)))).))))))))).((......))((((.((((.((((((.(.(((((((((.....(((......((((..((....(((..........)))))..))))......)))......)))))))))))))))).....))))))))...(((((((.(((((((((((........((((......)))))))))).))))).))......)))))..((((((.......)))))).........)))))....)))).))...)).))))))......))))))...)))).((((((...(((.((((((...(((((......))))).((.(((..........)))))....................)))))))))..)))))).........))))(.....(((((((((.((......))..)))))))))...........(((...((((((((((.(((((.....))))).....))).......))))))).)))........(((((((..((((((((((((((.(((((((...)))).........((((((.((.(((...((((...((.....((((((.(((((((.((((...(((....)))..)))).)).....((((((((((..(((...........)))..))).....(((.(((((............))))).)))....))))))).((((.(((.((((((............................)))))).)))...))))))))).))))).).....))...)))).)))...)).))))))..((((((.(((..................))).))))))........(((((...)))))...((((..((.........))..))))..)))..)))))))...(((((....))))).......))))))).))))))).((((.(((((.(((.....))))))))))))..(((........)))......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((,.({{{..(((.(((((({.({{...((.(((((((.((.......))..))))))).))..})))))))).}})..{(((((...)))))}........,,((((({{.{((({{{{,....,..,|||}.....,}}}},}))),))))})}.,,.((((((.......)))))),,....||..((({,{{.......((((((.((..((.((((..((((((((((((((((((...((((.,((((.((((((....((((.((..(((((((((((.((((((.(((,{,...((((((({..,((.(((..,....{{.{({{.................}}}}}},,.....,..))).))))))))))..),.))).))))))((((({....,))))}}...........,(((((........))))},,.)))))......))))))..)}))))..)))).))..))))))))...)))).))))))))).{{..,({,{{((((.{{{|,|||{{{.{.(((((((({..,{.(((((.....{(({,((,...(({..,....,..}}}}}.,},.,...,..))}......))))))))},}}))))..,,.}}}}})))},.||||}||||((((((((((........((((......)))))))))),))}},.|||..,))),,,}.|((((({.......)))))).........)))))....)))).))...)).)))))).....}))))).,||}||,.((((((...(((.((((((...(((((......))))).{{.{((..........})))}.....,{,....,.......)))))))))..)))))).........}}}}{.....(((((((((.((......))..)))))))))...........(((...((((((((((.(((((.....)))))..},.))).......))))))).)))........(((((((..((((((((((((((.(((((((,.,||||.........{{{{{(,((,{....,||||..,({....,|(((((.(((((((.((((...(({....}))..)))).)),,,,..{{,{||||{,,(({..........,|||,.},}.....{{{.|||||......,.....})))).}}),,.,))))))}.((((.(((.((((((.......,....................)))))).)))...))))))))).))))).......}}...|}}}.|||.|,}}.}}|||}..((((((.(((..................))).))))))........{{|||,,.)))})}}|{{{{..,,,..|,,.......,))).})))..)))))))...(((((....))))).......))))))).))))))).((((.(((((.(((.....))))))))))))..{{{........))),,....)
Forensic Context

No forensic context available.