Basic Information

Symbol
hsa_CCDC66_0012400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CCDC66_0048
Host gene
CCDC66
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:56649932-56652240 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:56615904-56618212 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-123.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -137.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 192.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((..(((((((((.(((.(((........))).)))......((((......((((((((......(((.((.(((((((((....(((.(((.(((..(((....)))..))).))).)))((((((..((...((((((.((((...((((.(((.....((..(((((((((.((((........)))))))))).)))..))...)))..)))).....)))).))))(((((((..(((.((........((((...........)))).........))..)))....)))))))...))...))..))))))....(((((...((((((.((((.((..(((.....((((....))))...............................(((...))).(((((((((((((......(((........)))))))))))..)))))................((((...)))).((((((.............(((((.((((((((.....)))))))).)............))))((...))))))))...)))..)))))).)))).))...))))).......))))).)))).))..)))....)))))))))))).........)))).))))).))((((((((........)))))).......))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((..(((((((((.(((.(((........))}.)))......,{{{......(((((({{.,,...(({.((.(((((((((.,,.(((.(((.{((..(({....,})..))),))).))}{{{,,(,{((,,.(((((({,,,..,.,,{,.(({,....}}}},,,{(((({{((((........)))))))))).,}}...(((((.(((((........))))).))))){{{{..{||.{|.}},,|,.{{{{...||||.}}.}}},.........}}..,,,....{||||{{,..,{{,{||..|||||,....{,......{{((({...,,}}|.,({{..((.((((....)))).)}...,,........,,,.,,,........{{|...,}}.(((((((((((((......,{{.,,.....)))))))))))..}))))................((({...}))).{{{{{{.,.........,.{,(((((({......,)))))),}}}}.}...........,}}}}||}..{{|||,,,.....)}}))}}},.))))}),.,}))))).,,,.,,))}))..)}}.})..)))....)))))))))},}....,....}))),,)))).))((((((((........)))))).......))
Forensic Context

No forensic context available.