Basic Information
Symbol
hsa_CD44_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0021714
hsa_circCD44_001
Host gene
CD44
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
11:35160417-35222742
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35138870-35201195
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-467.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-493.06 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
275.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((..(((((((..(((((((((((((((.(((((....(((((.(((((((...(........((...(((((((......(((....)))))))).))...))........).))))).((.(((.(((((((((((((((.(((((..(((((((((((((((...........((((..((((((((........)))))).....))..))))(((.(((.....((...........))....))).)))....(((......)))........))))))..)))))).))).))))).)))))).(((((((..(((((.....))))).))))))).....))))))))).))).))))))))).)))))))))))))))))......((.......))..(((.((((((((((.((((.......))))........(((((((((..((..((....)).))..)))))))))(((.(((..((.(((((.((((((((((.(((((......))))))))))))..........))).)))))))..)))...))).)))))))))).)))........))).)))))))..((((((...(((......)))((....)).....(((...)))..((((((((((.......(((.(((((((....((((((.(((((((........((((((....((((...(((((((.............((((((((((....................(((((((...)))))))........((((((......))))))..(((((.....)))))......(((.......(((((..(((((....(((..((((....))))...)))(((((....)))))))))).)))))......))).......(((((((.((((.....(((........)))..)))).........((.((((((........)))))).)).)))))))((((............)))).......))))))))))((((..(((.......)))...))))........)))))))(((.....))).....(((((((((((((....)))).(((...)))(((.((((((((.((......(((((.......))))))).)))))))))))..))))))))).......(((((((((..........((..(((((((((..........)))))((((((....))))))))))..)).......)))))))))..(((........)))))))....)))))).((....((((.((.((.((((...)))).)).)).))))....)).))))))).))))))...(((......(((........)))......)))))))))).))).))))))))))...)))))))))(((.((.((....)).)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((..(((((((..{({((((((((((((.(((((....(((((,(((((((...{(,...,.||{...,{({{((......({{....)))))))).})}}.}}..........}}}}}.((.(((.(((((((((((((((.(((((..(((((((((((((((...........,{{,..{{((((((........)))))),,,..}}..))),(((.(((..,..{{...........})....))).))).{{{({,......}},....,,,.))))))..)))))).))).))))).)))))).(((((((..(((((.....))))).)))))))....,})))))))).))).)),)))))),))))))))))))))))).,....{{.......|},.(((.((((((((((.((((,....,.}))}...,.,,{(((((((((.,({..({,....},)),,)))))))))|||,{{(,,{{.{,{(,,{,{((((((,{(((((......))))))))))))....,.||,..,,.}|}}}}}..))),.,}}}.)))))))))).))).,......|}}.||||}}}..,{{{{{,|,||(......))).{||,.||,|....}}))}{||,{((((((((((.......(((.(((((((....((((((.(((((((.....{,.((((({....,,,{...(((((((.............((((((((((....................(((((((...)))))))........((((((......))))))..(((((.....)))))...,..{{(.....,,(({{(..(((((..,,{{{..((((....))))...))}|{(((....)))},))))},|||||......}||,.....{(((((((.((((.....(((........)))..)})).,||.....((.((((((........)))))).)).)))))))|{{|............,))},,,....)))))))))),{{(,,(((.......)))..,))}}........)))))))(((.....))),,...((((((((({({,..,,|||}.,,|,..)))(((.((((((((.((,.....{((((.......))))))).)))))))))))..)))))))))...,,..(((((((((........,.,,..(((({((({..,...,...}))),((((((....))))))))))..))..,....)))))))))..(((,..,,...,}},))),.,,)))))).||...,((((.((.((.((({...)))).)).)).))},.......))))))).))))))...{{{......(((........)))......)))))))))).))).)))))))))),..))))),)))(((.((.((....)).)).)))
Forensic Context
No forensic context available.