Basic Information
Symbol
hsa_CD44_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0021718
hsa_circCD44_007
Host gene
CD44
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:35208379-35222742
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35186832-35201195
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-147.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-160.45 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
180.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((..(((((.....)))))...........((((((((...((((........))))(((....))).......(((((....)))))(((((((((((.(..(((((.......(((((((.((((.....(((........)))..)))).........((.((((((........)))))).)).)))))))((((............))))......)))))..).))((((..(((.......)))...)))).......((((..((.....))..))))...(((((((((((((....)))).(((...)))(((.((((((((.((......(((((.......))))))).)))))))))))..))))))))).......(((((((((..........((..(((((((((..........)))))((((((....))))))))))..)).......)))))))))..(((........)))....))))))))).))))))))..(((((........)))))...(((((...(((............(((((....((((......(((........)))......)))).....)))))...........)))))))).)))))).........((.....)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,,..((({{{..(((((.....))))).......,,..((((((((.,.,(((.,...,,,|,,{(((....)))}...}},|{(((....)))}}{{((((({{((.{..,{{((...,,.,(((((((.((((.....(((........)))..)))).,||..,..{|.((((((........)))))).}}.)))))))|(((............}}},.|||..|||}}..,.,,,{{(,,({{.......})}.,|)),|.......{{{{..({.....}}.,))))...((((((((({({,...,|||}.,,|,..)))(((.((((((((.(({.....{((((.......))))))).)))))))))))..))))))))).......(((((((((........,.,,..(((({((({..,...,,..}))),((((((....)))))))))}..))..,....)))))))))..(((...,,...}}}.,,.}}))))}}),}))))))).,(,,(({(,{....))))),.,|{{|{,.,{,,...........,|{{((,,{.{{,,......{{|...,,,,.))).....,)))).....,}})).,,.....,,.)))))))).))))}}.,..,,....}}.,}.}),
Forensic Context
No forensic context available.