Basic Information

Symbol
hsa_CD44_0004000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0021723 hsa_circCD44_015
Host gene
CD44
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:35218293-35236461 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35196746-35214914 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-305.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -326.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 269.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((......((((....))))..))((.((((..(((.(.(((.(((....(((...(((((...((((((.(((.(((((....(((((..(((((....(((((((((..........((..(((((((((..........)))))((((((....))))))))))..)).......)))))))))..((..((((.((....))...))))..)).....)))))..))))).......((((((((...((((((...(((.(((((...((((((.((((......(((........)))......))))......(((..(((...((((...((((((((((((.((.((....)).)).))))((((((.......((((....))))...........((((...)))).........(((...((.(((..(((((...)))))..))))).))).........)))))).((.(......))).......))))))))..)))).)))...)))...)))))).....))))).)))....))))))..)).)))))).....))))).)))..)))))))))))))).......(((((((((((((((((.(((........((.(((.......))).)).........)))...))))....((((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..))))))...((((((.....(((....)))...........(((((((((.((((....((((((....))))))(((((((...(..(......)..).)))))))........))))..(((.....)))((((...))))...........)))))..))))..........)))))).....((((((((.((((((((..(.....)..))))))))..))))))))(((.((((((.......((((.((..........(((((((.((((...))))................(((((.........)))))...))))))))))))).......)))))))))........))))))))...((((((...)))))).....((((.....(((((....))))).....)))).......((((....)))))))))......))).))).))))..)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((......((((....)))).,))((.((((..(((.,.(((.(((....{,,...(((({..,((((((.(((.(((((,...(((((..(((({.,..(((((((((..........,,..(((({((({..,,,,,,..}}}},((((((....)))))))))}..))..,....)))))))))..((..((((.,,....}}...))))..))...,.)))))..)))))..|,...{(((((((...((((((...(((.(((((.{{(((,,{.((((......(((........)))......)))).....}|||}.{{{...((((...((((((((((((.((.((....)).)).))))((((((......,(({,....||||......{,...((((...)))).,.,.....{{{..,((.(((..(((((...)))))..)))},.))).........)))))).,,.......,||,....,,,))))))))..)))).}}}...,}}..{|.,,,)}....))))).)))....))))))..)).)))))).....})))).)))..))))))))))),,,.......((((({(((((((.,,,.(({.......|((.(((.......))).})......,,.|||{{{|{||,{..((((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..))))))...(({{((.{{{{({(,{{,|||,,{{{,.....{{{{{({({.{{{{....((((((....)))))){((((((,,,(,.,....,,},.},))))))}........}}}},,{((...,,|||,{(({{{|||,.........)})))))||}|,},.........}},))).....((((((((.((((((((..(.....)..))))))))..))))))))..{,{,{{{{..||...|||,|||,},.......{{{{{{(|{(({,..,|||,|,.............{{{||.......,,)))))...||||}}},,,||}.....}})))))))))))),)}}.)))))))}...((((((...)))))).....((((.....(((((....))))).....)))).......((((...,)))))))))......))).))).})))..)))).))
Forensic Context

No forensic context available.