Basic Information

Symbol
hsa_CD44_0008700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0021732 hsa_circCD44_025
Host gene
CD44
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:35223218-35240934 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35201671-35219387 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-225.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -242.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 231.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(.(((.......(((((((.......((((..(((((....((((.......(((...((.(((..(((((...)))))..))))).)))........))))..........))))).....)))).(((((...............)))))((....))..)))))))))).).)))..(((.((..(((.....((....((((.......(((((((((..((.....(((((((((((((((((.(((........((.(((.......))).)).........)))...))))....((((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..))))))...((((((.....(((....)))...........(((((((((.((((....((((((....))))))(((((((...(..(......)..).)))))))........))))..(((.....)))((((...))))...........)))))..))))..........)))))).....((((((((.((((((((..(.....)..))))))))..))))))))(((.((((((.......((((.((..........(((((((.((((...))))................(((((.........)))))...))))))))))))).......)))))))))........))))))))...((((((...)))))).....((((.....(((((....))))).....)))).......((((....)))))))))...(((....)))(((((...)))))......))..))))))))).....))))..))..............(((((...)))))..)))..)).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{({.,.({,...,{,,,,{{|||||,.,...{{,..((((,..}}||,.,,....,,{{,,(((,(((..(((((...)))))..))}|,,}||........}})}....{{.,...,,,}},...||||.(((((...............))))),,...,)),.,,||}|||||.,.,))}}|{|}||},|||.....,................(((((((((..,......((((({(((((((.,,,.(((.......|((.(((.......))).))......,,.|||{{{{{{|{{..((((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..))))))...(({{((.{{{{({(.,,,||}.,|{{,.....{{{{{({({.(({(....((((((....)))))){((((((,{,(,.,....,,},.},))))))}........}}}).,{((....,|||,{(({{,|||,.........)})))))||}},},.........}}}))).....((((((((.((((((((..(.....)..))))))))..))))))))..{,{,{{{|..||...|||||||}},.......{{{{||{|{(({,..,}||,|,.............{{{||.......,,)))))...|||||}},,,|||.....}))))))))))))).)},.)))))))}...((((((...}))))).....((((.....(((((....))))).....)))).......((((...,)))))))))...(({....}))(((((...))))),.....,}..))))))))).,|,.|||}..},.....,.,},)}}|(((((...)))))..,}}...},))).
Forensic Context

No forensic context available.