Basic Information

Symbol
hsa_CD44_0000500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CD44_0030
Host gene
CD44
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
11:35171829-35172810 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35150282-35151263 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-266.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -282.09 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 211.01
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.