Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0283400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CD44_0021
Host gene
CD44
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:35220959-35221429 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35199412-35199882 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-132.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -139.16 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 70.78
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.