Basic Information

Symbol
hsa_CD44_0007400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CD44_0064
Host gene
CD44
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:35222629-35236461 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35201082-35214914 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-233.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -251.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 276.64
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((..(((.(((((...((((((.((((......(((........)))......))))......(((..(((...((((...((((((((((((.((.((....)).)).))))((((((.......((((....))))...........((((...)))).........(((...((.(((..(((((...)))))..))))).))).........)))))).((.(......))).......))))))))..)))).)))...)))...)))))).....))))).)))...(((((..((((((((...................(((........))).......(((((((((((((((((.(((........((.(((.......))).)).........)))...))))....((((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..))))))...((((((.....(((....)))...........(((((((((.((((....((((((....))))))(((((((...(..(......)..).)))))))........))))..(((.....)))((((...))))...........)))))..))))..........)))))).....((((((((.((((((((..(.....)..))))))))..))))))))(((.((((((.......((((.((..........(((((((.((((...))))................(((((.........)))))...))))))))))))).......)))))))))........))))))))...((((((...)))))).....((((.....(((((....))))).....)))).......((((....)))))))))...)).)))))).))))).....))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{{..{{,..{{{{{(({(({{{.{{{{......(((........})),.,,,.))))...,,|||||,{{,...((((...((((((((((((.((.((....)).)).)))){(((((......,(({,....||||,.,...{,...((((...)))).,.,.....{{{..,((.(((..(((((...)))))..)))},.)}).........)))))}.,,.......,||,....},,))))))))..)))).},,....||..{{....)}...,}}}}}||||...{{(((,,({(({(((.,,{.,,,...........,,....{{{{.,,,.......||||,{(((((((.,,,.(({.......|{(.(((.......))).}}......,,.|||{{{{{||{{..{(((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..)))))}...(({{((.{{{{{{(,{{,||}.,|{{,.....{{{{{({({.{{{{....((((((....)))))){((((((,{,(,.,.,..,,},.},))))))}........}}}},,{((....,|||,{(({{{|||,.........)})))))}|}|,},.........}},))).....((((((((.((((((((..(.....)..))))))))..))))))))..{,{,{{{{..||...||||,||}},.......{{{{||||{(({,..,|||,|,.....,.......{{{||.......,,)))))...|||||}},,,|||.....}))))))))))))),)},.)))))))}...((((({...)))))).....{(((.....(((((....))))).....)))}....{{,({({...}))))))})},,,)).))}})),}))))....,},,,
Forensic Context

No forensic context available.