Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0283500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CD44_0112
Host gene
CD44
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:35230081-35230656 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35208534-35209109 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-123.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -134.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 201.73
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..((((..(((......(((((((.((((((....(((((((((((................(((((((....).))))))....(((((..(((...(((((......))))).)))..)))))......(((((((((.((((...(((.((((((((..............((((...)))).(((((((.((.......)).))))))).)))))))))))..))))....(((..((((((((((((((((.(.......))))))))).........((((((......((((((..((....))..).)))))......))))))...)))))))).))).(((((((.........)))))))..)))))))))..))))))))))))))))).(((..........)))(((((((...)))))))...(((.......((((..((((.(......).)))).))))......))).........((((((((.((.(((((((...................)))).))).))..)))))))).)))))))...)))..))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
..((((..(((......(((((((.,,..,...{{{{{{{({{,{,......,,........({(({{,...{|,||||}}.,..{{{{||||||...(((((......))))).,},.|)))}}......,||{{||{{.{{{{,..{({.((((((({{,......|{{{,,{{{{.,,)))).{{{{{({,((.....,,}}.})))))),))))))))))}..,|||{.{{....,{{((({{((((((((({(.......)))))))))}..}},.......,(((.(((((((.(({({...{{{(,{..,|{||||,,,{{.{{.,,,)),,}}}},..,,,{||||,,}}}.,,,.,}}}}}},.|||||||},.,}))))))))}},))))).}||}}}}..}))....{((((({...))))))}...{|,.,},,,,{({{..|||{.{....,,}.}})),)))),},...))}}}},.....(({{{{{{.{{.{{{{{{{,|.,............,..}))).))).)),.)))})))),)))))))...)))..))))..
Forensic Context

No forensic context available.