Basic Information
Symbol
hsa_CCDC66_0002900
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0124284
hsa_circCCDC66_005
hsa-CCDC66_0012
Host gene
CCDC66
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:56597712-56649300
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:56563684-56615272
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-339.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-369.01 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
431.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((.....))..(((((((((........((((((..........(((((((.((((((.....(((.(((((...))))).))))))))).....(((((.....)))))..((((((((........((((.........))))......((((((..(((((((((((.....))))...........((((..(((((.....)))))..))))...))))))))))))).(((((..........)))))...((((((.................))))))((((........))))........((((((((.(((((.............))))))))))))).........))))))))...((((.((.....))))))...((((.((((((..(((((((((((....(((.(((((.....(((.....))).......)))))((((((((((.((((....(((((....((((((((.((((.(((...............))).)))).))))))))......)))))....)))))))).))))))........(((....)))...(..((((.((((....))))))))..)......(((...)))(((((.....))))).)))..))))))))))).)))........))).))))...........)))))))))))))...(((((((....((.(((.((((..................((((((((.............((((((((........(((..((((...................))))..)))........)))))))).(((((((((..((.....))...)))))))))..........(((((.............(((.((((((.........(((..(((((((.((...........)).)..............((((((.((...(..(((.....)))..)...)).))))))...........)))))))))..........)))))).))).(((((................)))))...(((((((((((((((((...))))))((((((....)))))).((((....))))...(((((........)))))..(((((...))))).((.((((((....(((....))).....))))))))..................(((((((((((((....((((((((((..(((..((((.(((((..........................))))).))))..(((..........)))....)))..))))))...))))..)))).....)))))))))...........(((((((..(........)..)))).)))..(((......)))..)))))))))))..((((((.......))))))...............((((....((((...((....))...))))....))))......)))))...((.(((...))))).))))))))..................((((...))))....)))).))).)).....))))).)).......))))))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.({.....}}..(((((((((.....{(((((({{..........,{{||||.{{{(({....,(({.(((((...))))).}||||||||.....(((((((.......((({({{{{{{{.......|||{.,,,...,{||||,,....{((,,(({..,,,)))))}}...{(..(((((.((.{(...)).)).)))))..)),((((({{.{{{.{{{{,...)))),,|((({..........)))))...{(({{{....,,,,,,.,,,,,,|}||||((((..,,,,,,|}||,.......{(((((((.(((((.............))))))))))))|{{..,,,.,,,,,...,...{(((.{{,,...},}}}}...{{{{,{{,.,,..(((((((((((.,..(((.,{({{.....(((.....))).......)))}|{(((((((((.((((....(((((....((((((((.((((.(((..{{........,..))}.)))).))))))))......)))))....)))))))).)))))}|....,,.{{|..|,||,...{..((((.((({....})))))))..}...,..||{...)),(((((.....))))).)))}.))))))))))).}}}}.,....,|||,||}}..{{.......}||}}}}}||||..,.{|||,|||||||{{{{{{{(({...,,,...{,,,......,||||}.......||,....|||({{{{.....||,|{,.,{|{{.........,,........}}|}..|||{{...,,.|||||},,.(((((((((..((.....}),..)))))))))....,.,,,.,,....}}....|||||||||||||||,...,,|....,...{{|,,{{.||...........,|||,.....,,......{{{{{(,{({..(..(((.....)))..)..,}).)))))}|||..,...}}})},,}})}}))}},.,))),,}})}))}}|||||}}.............,}))}}..,||||||{{{{{((((((...))))))((((((....)))))).((((....))))...(((((,,...,,.)))))..(((((...))))).((.,,,,||...}|||,,,,,)),)}}}}))))))}.....,,...........((((((((((({{.,..((((((((((..{((..((((.{((((........,........}........))))}.))))....,...,......|||{...})),,))))))...))))..)}},...,,,))))))))...........{{({{{{..{........}..)))).))}..{{(......))).})))}}}}}}},..((((((.......))))))...,,..........((((....((((...({....}}...))))....))))......|||.||.,|}.,.|,,,})))).,,....,,..............,,,,||,,...)))),,},,)))})})})..,.,,}|,.....,,.....))))))))).
Forensic Context
No forensic context available.