Basic Information

Symbol
hsa_CD44_0011800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CD44_0052
Host gene
CD44
Type of circRNA
Intron-Exon
Location (GRCh37)
11:35243810-35244364 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35222263-35222817 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-106.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -119.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 156.17
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((((..(((((((((((((.(((((((.((((.....(((((((((((((((.(((((((((((((((((.((((.....((.((((((.....)))))).))..)))).))))).))))...)))))).)).))))))))((((((((.(.(((((((....))))))).).)))))))).........(((((...)))))........((((((((((((......(.......).......)))))))))))).......))))))).............((((((..........))))))..(((((.(((((((.((((((((((((((((....)))))))........)))))))))...))).))))...)))))..)))).)))))))....)))))))))))))..))))(((((((....))))))).....)))((((....((((..(((((((..................((((((....((.(((.........)))..))...)))))))))))))..))))....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({,.{(((,,((((((((((((,.{({((((,{{,,.....{((((((((((((((.(((((((((((({((((.{{((..,,.((.((((({.....}))))).)),.)))}.})))),))))...)))))).)).))))))))((((((((.(.(((((((....))))))).).)))))))),..,,....{((((...))))).,,,....((((((((((((.....,,.......}.......)))))))))))).,..}},))))))).......,.....{(((((.{,,,,....))))),..(((({.(((({{{.((((((((((,((({{{{,.,}})))}...,,,.})))))))))...})}.))))...))))}..|||||}}}}}})|||,,}}})|||||,||{,.||.{{{{|||,,,,)))))}},)),})))|{||,,,.{(({..(((((((..,,,,,...........((((((..,.{,.{((.........)))..,}...))))))))))))).,))))....}}))
Forensic Context

No forensic context available.