Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0283900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CD44_0079
Host gene
CD44
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:35252441-35253247 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35230894-35231700 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-247.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -265.14 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 173.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((....)))))).))))(((((.....))))).........(((((((((((...(((((((.((....((((((((..((......))...))))))))...)).)))))))..(((((.....((((......))))...)))))....((......))((((((((.((((..((((((((((((((.(((((((.........))))))).....((((((((((.(.(((((((((.........(((..(((((((....))).))))..)))(((........)))....((((((((((((...(((((((.......)))))))..((((((((..((..(((.(((((.(((((.((.((((((((((....))))...((((((..((((((((((((......((((((.....))))))......))))))....(..((((((((..........))).)))))..).........((((((((...(((........)))..))))))))((((((((.......))).))))))))..))))))))).))))))..)).)))))))))).)))...))..)))))))))))))))))))).))))))))).)))))).)))))......(((((((..(((.(((((..(((((..(((....................))))))))))))))))..)))))))(((((...)))))..)))))).))).))))).)))))))))))).....)))))))))))((((((......))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{{.((((((....)))))).||||(({{{...,,))))).........(((((((((((.{.(((((((.((....((((((((..((......))...))))))))...)).)))))))..{((((.,{{.((((......}}}}...)))))....,,.,,.,,))((((((((.((((..((((((((((((((.,{{{{{(.........}}}}}},.....((((((((((.(.((((((({{{,,....{{(((..(((((((....))).))))..))).}}......,.},.,,.,((((((((((((...(((((((.......)))))))..(((((((..,(({.{{{(((((..(((((,{{((((((......}}})))...,,})))))..}}}||((((((......((((((.....))))))......)))))).,,,(,{((,(({{(.,,.......}}}.}}}||{,|....||||||((((((({,...|},,,,}}}}.....,,,,,,,{((({{{{,,,....))).)))))))}..,.})}}|||{|..{{((((.....))))))..,,),,,)))})))))))))))))))))))).})))))))).))))))))))))..,,,.(((((((..(((.(((({.,(((((..(((....................))))))))))))))))..))))))||||{{...}))})}.)))))).))))}}))}.)))))))))))),..,.))))))))))),(((((......))))),
Forensic Context

No forensic context available.