Basic Information
Symbol
hsa_ABCA1_0004200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0011
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107564335-107568711
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104802054-104806430
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-116.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-125.28 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
78.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.......((((((...))))))..((((((((.(.(((.(((((..((((((((((((((..((((.....))))..))))..(((((.((.(((((..........))))))))))))((((((.(..(........)..).)))))).((((.(((((...)))))((((((....)))))).))))..............(((((.((((.((((...(((.((.((...(((....)))...)).)).)))))))..)))).))))).....(((.....)))............)))))).))))..)....)))))))).))))))))...(((((((.((((..((..(.((((.....)))))..)).)))).))))))).(((......))).......((.......)).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,.....{(((((,,.}}}}||{.((((((((.(.(((.(((({..((((((((((((((..((((.....))))..))))..(((((.(,{(((((..........)))))))))))),{,((({(..,........,..}.)))))).{{{{{(((((...)))))|(((((....)))))}.},,,..............(((((.((((.(((({..,{(.((.,{,,.{{,....)))...,,.)).)))))))..)))).))))).....(((.....)))............)))))).))))..}....)))))))).)))))))),,.(((((((.{{{{{{({..{.((({.....)))),..},.))},.))))))).{({......}}}.......||,....,})),...,
Forensic Context
No forensic context available.