Basic Information

Symbol
hsa_CDC14A_0002500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0013324 hsa_circCDC14A_002
Host gene
CDC14A
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
1:100856288-100950926 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:100390732-100485370 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-442.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -479.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 525.55
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((...(((.(((((((.((....(((....)))...)).))))))).)))((....((((....((((...(((((.(((((..((.((..((..(((......)))..))..))..))..)))))))))).....))))...))))....)).((((...........)))))))..((((((((((((((((.(((((...((((((((.((((((((((.(((((..((((((((...............)))))))))))))))))...((((((............))))))......)))))).))))))))......(((((....)))))...........((.(((((((.....))..))))).))....((((((..((.......(((((......)))))........))...)))))).........))))).)))))))..(((..(((((...........((((((.....))))))((((.((((((((((((.........))).(((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))).))))))....))))))))..)))))((((((....(((((((((((..(((......)))..))))))...........((((((...(((((((((((((((((((.....))).........((((((((((.((.((((...))))........))...)))).))))))..(((((...)))))(.(((((.((((....((.((((.(((..(((((((............))))))))))..(((((.....))))).)))).)).......................(((((((..((.((((...((((((....(((((((...))))))).))))))....)))).)).)))))))))))))))).)...........(((((.((((((((.(((.(((.....)))))).((((.....(((((((((.(((.((((((..((.....))...((.......)).(((((((((..............(((((((((.....)))))))))..((((....))))....)))))))))...))))))..)))...((((((((....(((((.(((((...............))))).))))).........((((...((((((..........(((((....))))).........))))))..)))))))..))))).(((.(((((((...................))))))).))).............)))))))))..))))..((((.(((....(((((....((((((......))))))...))))))))))))(((.(((......))).)))........)))))))).))))).........))))))))).(((((...((.((((((......)))))).)).))))))))))))...))))))....)))))..)))))).(((((.(.((((...((((((.((((((.....((((((((.........((((((....))))))....((((((...(((.(((((((((((((((((((....(((((....((((((...((.(((........))).)).....))))))..)))))))))))))))))))....))))).)))...)))))))))))))))))))))))))).....)))).)..))))))))))).))).)))))))))..))).......)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,....,.({{,((((((,.{(,...{({((,,.,.|||||{||}},,}.}}},{{{,{{{((...,{{{||,||||||,|})))),...}))),|..|||.,{{,,|||{{,,..,,...{.{(((.((((.......))))..))))}.......((((({{.....{{((((|.,((((,(((((((((((((,.........((((((((.((((((((((.(((((..((((({{{...,.........,,)))))))}))))),,,}...{(((((..,,........)))))}.}}}}.)))))).)))))))).,,,..(((((....)))))...,,,{({,.((.(((((,(,....,,,}))))).)),}}},|{{{{,.((....}},||||,.((((((..,(((..((((((((.,{{{.....(((({.{,({{{{{{{(((((,,(((.............,,.{(((((..{{{|||,,,.}).}|||,|}}}}|,|{,..{{{.(((.((((((..((((..((((.....((((((......((.((((.(((((((.....((.(((....))).))))))))).)))))),))))))....))))))))..)))))).)))..}}},{..(((((((..(((......)))..)))))))..}}.,,)))...}}}}}))),,)).}}}.}.}}})){{{...(((((((((...((((((((((.((.,{{{...,,,,........)}...)))).))))))..(((((...}})))..{{{{(((({,....(({.,(((((((.((((((({.,,,.....,,),)))))},|{{(((((.....))))).,))},||,..,,|||,.............,||{{{||,,|(,((((,..(({(({,,..(((((({...))))))).,}}||}.,,,}}}},)).)}))))}}}})))}|||{{,{.....}}}}.,}}))}},}}|,||||}||,..,}},.....}}}}}.....)))))))))..}}),},.....||..,},)}.)))))))).......(((((((((((................))))))).))))........{(((....))))))).)))))).......((((((((................)))))))),{||..{(({{{{{.....||....,}}...}}}}}}}}{(((...((((((..........(((((....))))).........))))))..)))))).)))))))}}}).}))}||,..}}}}}}.....)},,)))),,)))}}}}},,..........(((((((((((((((({{(({.{({,..{(((((,,..((((((......))))))..,})))))||||}}(((.(((......))).))).,,....,,}},.((({.((((((((((.((((.((((.((((((((.((..((((((......)))))).{{(({.{(({{..({{({(({,,{,.,,..,|||,..,,((({{.{{{{......,,)))).)))))......,,,..,,)))}}..}}||{.,..((((((((,,{((((.,.{{.....,}}.)))))))))))))..,.|}}..}}))}.)}.))))))))...)))).)))).)))}.,)))))}..)))).,}.))))))).))))))))))..,}}}}}|{(((((.{......,))))))}{{{||,,.,|,,.{,,,{{{.,,,})}|}}}{{{{{{....,.))))}}.,,|||{||.,,,,.,,}}))}
Forensic Context

No forensic context available.