Basic Information

Symbol
hsa_CCDC66_0012600
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0124290 hsa_circCCDC66_017 hsa-CCDC66_0033
Host gene
CCDC66
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
3:56649950-56653929 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
3:56615922-56619901 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-200.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -224.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 214.41
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((......(((.((((((((.((((..........(((((((((.(((.(((((((((.(((....(((((((((..((((.((....)).))))...............(((.(((((((((...........((((....))))(((((((((.((((........)))))))))).)))...(((((.(((((........))))).)))))((((..(((.((........((((...........)))).........))..)))....)))).(((..(((.((((.(((((.............(((((((..((.....(((..((.((((....)))).))...)))..))..)))).)))........(((...))).(((((((((((((......(((........)))))))))))..)))))................((((...)))).(((((((((((((..(.((((((((((........)))))).)))).)..............((((...(((((........))))).......))))...)))))).))).))))....................))))).)))).))).))).....(((.((....(((((((((........))))))..))).....)))))..)).)))))))))).((((((............................)))))).)))))))))...........(((.(((((..((....))..)))))...)))..)))..)))))))))..))).)))))..))))......)))).)))))))).))))))).....(.((.(((......((((((((....((((((.(((((((.......)))))(((...((((..((.((((....((.((((.(.......).))))))....)))).)))))).))).(((((..........))))).)))))))).......))))))))..........((((...)))).....))).)).).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,......(((.((((((((.((((..........{((((((((.(((.(((((((((.{{{....(((((((((..({({.{{....,}.}}}}......,,,...,,,(((.((((((({,......,,{{{((,,....,}},,,,((((({{((((........)))))))))).,}}...{((((.(((((........))))).)))}|((((..(((.((.....,..((((...,,...},.)))).........))..)))....))))}||,..{((,((((.(((({.....,,......{{(((,...,,}}}.,({{..((.((((....)))).))...}}.......,,,,.,,.........(({...})).(((((((((((((......,{{.,,.....)))))))))))..}))))................((({...}))).(((((({((({{{..,.{.,,(((((({......,)))))).||||.|..............{{{{...(((((........)))))..,,,}.)))),..}))))).))).))))...........,..,.....})))).)))).))).}}}.....((,,((....(((((((((........))))))..))).....))))).,)}.)))))))))).((((((.......,............,.......)))))).)))))))))...........{({.(((((..((....})..)))))...}}}..}}}..)))))))))..))).))))),.})}}......)))).)))))))).)))||,......,,,|.,,.......((((((((....((((({,(({((((.......)))))(((,,,((((..,,.,{,({{..((.((((.(.......).))))))...}))}}.}})))).}}}}|||{|,,........,}}}}.)))))))).......))))))))..........((((...)))).||,|,.,,|||,..}})
Forensic Context

No forensic context available.