Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0000100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0079928 hsa_circCDK13_001
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:39989959-40041630 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39950360-40002031 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1113.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -1157.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 632.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((.((((((((((((.((((.((((..(((((((.(......).))))((((((((((.(((((((((((((((((..((.((....)).))..)))))......(((((...)))))....((.(((((..(((((.(((((.((((..(((((((.(((((..(.((.((.(((((......)))))..)).)).)...))))).)))))))..)))).)))..)).))))).)).)))))..(((((((((.(.((((.(((((.(((..(((...)))))))))))))))).)))))).))))))))))))))))).(((((((((((....(.((((((.(((.........((((.(((((((...((.(((((.(((((((.(((((((((((((((((((.((((.(((((((((((.((((((((((((((((.(((.(((.(.(((((((......((((((.(((((((((((((..(.((((((.((((((((((.(((((((((..((((((.((((.((....)).))))..).))))))))))))).).))))).))).))..)))))).)..))))))..))))...))).))))))))))))).).))).))).))))...(((.(((((.......))))).))).))))))))))))......(.((((((((......)))))))).)(((....(((........)))....)))..))))))))))).)))).)))).......))))))))))))))).))))))).))))).))(((((((.(((((.....(((((((.(((((.(((((........)).)))))))))))))))((((..((((..((.(..((((((..((.((.(((((.((........))))))).))..))..))))))).))..)))).))))...(((.(((.(((((.(.(((((((..(((((..........)))))..(((...((((((((.(((......((((.((.((.((....)).)).)).)))).....)))))))))))...))).((.((.......)).))......))))))).).)))))...))).)))((((......)))).(((.((((((.....(((...)))..(((((..((((((...(((.((......))...))).))))))...))))).)))))).)))..((((..(((((.((((((.(....))))))).)))))..)))).((((((...)))))).)))))..))))))).((.(((..((((((((((((.(((.........))).)))))))).))))))).))......))))))).))))))).)))))).)..))))).)))))).........))))))))....))).))))...))).).))))).(((((.((.((((.((((((((...........)))))...)))))))((((((..(((((((((((((...((..((((((((((((.((....(((......)))....)).)))))))))...)))..))...)))).....((((((((((...((((((.(((((.((((((((((.(((....................)))...((((((...((((((...((..((....(((((....)))))....))..))...))))))...))))))))).))))))).....)))))....((((.((((((.(((.((((..(((........))))).(((...))).......)).)).).))).))))))).......((((((....(.(((((((..(((.(((.(((((..((((......((......)).....))))))))).))).)))....))))))).)...))))))((((((...................))))))..))))))..((.(((.....))).)))))....)))))))((((((.(((((...)))))...........(((.((...(((((.((((.(((((..((.(......((((((............))))))......).))..))))).)))).)))))...)))))........)))))).)))).)).)))....))))))......((((.....((((((....................)))))))))).....)))))))((.(((.(((....((((((.....))))))....))).))).))....))))))).)....(((((((..........((((((((.......)))))))).((.((((...)))).)).....((((((((.((((......(((((.((((.((.((((((.((.(((((((((((..(((..((((((........(((..((...(((((........).)))).....))..)))........)))))).))).)))))).....((((....))))...........))))))).)))))).)).)))))))))...)))))))).....))))...............))))))).......))))))((((..(((....)))..)))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((.(((((((,,,,({..((((.((((..((((.((...,((((({{{((,,.,,|||}|||||||||||{,{{(({{(((.,{{{{{|{||,,,,|||,.{{{.{((((...}}}||{{{..,.|||||..{||||.||||{,((((.,(((((((,(((((.,{,((.{(.(((({,,,,.,|||||..||.,}.}...})))),)))))}),.)))).)}},}),.))))),)).)))))}.{{{((((((.(.((((,{((({{(((..(((...))))))))))))))}|.))))||,||||||}||||||{|||,({({{((({{{......,((((({(((,{{{{.,..{{{{.||||,||}||(({(((((.(((((((.(((((((((((((((((((.((((.(((((((((((.((((((((((((((((.(((,((({(.({(((((......((((((.(((((((((((((..(.((((((.((((((((((.{((((((((..((((((.((((,({....)).))))..).))))))))))))).,.))))).))).))..)))))).)..))))))..))))...))).)))))))))))))})})),.))).))))..,(((.(((((.......)))))}))).))))))))))))......|.((((((((......)))))))).|(((....(((........)))....))),.))))))))))).)))).)))).......))))))))))))))).))))))).))))),,}(((((((.((((({,{..(((((((.(((((,(({{(.{,....})}})))))))))))))))(({{.,((|{,}||{(({((((((,.((.((.(((({{((........))))))).))..)).,|||}|||{|}.{||||.||||{{{(((.(((.(((((.(.(((((((..{((((....,,....||}||..(((...((((((((.(((......((((.((.((.((....)).)).)).)))).....)))))))))))...))).||.||.,,.)).}|,}}..}}..))))))).).)))))...))).))){{{{...,,.)))).,{{.{|||||.,,,,(({...}))..{((((..((((((...(({.((......))...))}.))))))...))))),))))))})),..((((..(((((.((((((.(....))))))).)))))..)))).{(((((...)))))).)))))..))))))).{|,|||,.((((((((((((.(((.........))).)))))))).))))})}.)),,,..,})))))),))}))))})))))}...((((((.|.((((....)))).}))))))}.}},))))}}.,})},,},).)))))))}.,)))),})})).))))..)))).....,,((((,(((({(..{{.((((((..((((((((({..(((.....,({.((,((((,.......,,,.(((((((...((((((..(((((....{,.........))))).,,{((((((..(.,((((((((....)))},((((((({{(({...,..............,{({....(((((...((((((,..{(((.{...{(((((...{|,|||....))}.))...))))))..))))))))))...)))))....)))).......{{{{.,.(((....,))}}..,,,......,})))))}}.}}.(({{{..{......})),,.},,)))},.........,,{{{,....{.(((((((..(((.(((.(((((..((((......{{......}}.....})))))))).))).)))....))))))).}...}}}}}|((((((...................))))))})))),})..))))))}..)))))))))))))..{{|,{{..,..,,.(((((...)))))........,,.}},......(((((.((((,{((((..{,((.,....((((((.....,......)))))).....)).}}.))))}).)))).))))))))))}.)),......)))..}.)))).)).)))....)))))).....(((((....,((..((((,...{({.,{......})}))))))))..)))...)))))||,|||}}}...}))),{((,....}}}}}}....,))})...))....))))))).)....(((((((..........((((((((.......)))))))).||.((((...)))).,}.....{(((((((.((((..,...(((((.((((.{(.((((((.((.((((({((((({{(((..((((((......,,({(,,({...(((((........).)))).....}},,))},,,.....)))))),|||.,,},,,.....{{,|,,,,)))),,,........))))))).)))))).)).)))))))))},.)))))))}.,}}}}.||....,..........))))))).......))))))((((..(((....,})..)})))
Forensic Context

No forensic context available.