Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0002500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0079929 hsa_circCDK13_005 hsa-CDK13_0005
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40027198-40027857 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39987599-39988258 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-162.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -175.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 158.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((......((..((....)).))......((((((((.((....(((......)))....)).))))))))))))))..))))(..((.(((((((((((((((...((((((.(((((.((((((((((.(((....................)))...((((((...((((((...((..((....(((((....)))))....))..))...))))))...))))))))).))))))).....)))))....((((.((((((.(((.((((..(((........))))).(((...))).......)).)).).))).))))))).......((((((....(.(((((((..(((.(((.(((((..((((......((......)).....))))))))).))).)))....))))))).)...))))))((((((...................))))))..))))))..((.(((.....))).)))))....))))))))).....(((((...)))))...........(((.((...(((((.((((.(((((..((.(......((((((............))))))......).))..))))).)))).)))))...)))))........)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({((((({.......{,,((....,,.,}..,}},((((((((.((....(((......}))....)).))))))))))))))..)}}}(..((,,{,{(((((((((((,..,{,((({,,,.},||{(((((((,(((...,,..............,|||...,(((((...((((((...{({{,{...,(((((...,|,|||....))}.))...))))))..})))))))))..,)))))....}))),......{(({,{.(((....,))||..{{{.......,))))),},||,(({{,.,{,.....))),..}},)))},....,,{{,{{{{{{....{.(((((((..(((.(((.(((((..((((......{{......}}.....})))))))).))).)))....))))))).}...}}})))||||||,|,.....,..,,,.....}},}}},.,})))}..,|,{||.....)))}))))),...})))))))},.,,.(((((...)))))...........(((.({...(((((.((((,{((((..{,((.,....((((((.....,......)))))).....)).}}.))))}).)))).)))))...))))).....,..}}))),.)
Forensic Context

No forensic context available.