Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0002600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0134280 hsa_circCDK13_006 hsa-CDK13_0030
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40027198-40037263 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39987599-39997664 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-196.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -213.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 195.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.