Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0002800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0001699 hsa_circCDK13_008 hsa-CDK13_0002
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40027198-40041630 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39987599-40002031 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-275.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -299.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 308.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((..(((((((((((((...((..((((((((((((.((....(((......)))....)).)))))))))...)))..))...)))).....((((((((((...((((((.(((((.((((((((((.(((....................)))...((((((...((((((...((..((....(((((....)))))....))..))...))))))...))))))))).))))))).....)))))....((((.((((((.(((.((((..(((........))))).(((...))).......)).)).).))).))))))).......((((((....(.(((((((..(((.(((.(((((..((((......((......)).....))))))))).))).)))....))))))).)...))))))((((((...................))))))..))))))..((.(((.....))).)))))....)))))))((((((.(((((...)))))...........(((.((...(((((.((((.(((((..((.(......((((((............))))))......).))..))))).)))).)))))...)))))........)))))).)))).)).)))....)))))).....(((((....(((..((((....((((((......)).))))))))..)))...)))))((((((......)))).))...((.((((((...((((((((((..................(((((((..........((((((((.......)))))))).((.((((...)))).)).....((((((((.((((......(((((.((((.((.((((((.((.(((((((((((..(((..((((((........(((..((...(((((........).)))).....))..)))........)))))).))).)))))).....((((....))))...........))))))).)))))).)).)))))))))...)))))))).....))))...............)))))))............))))))))))...))))))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{.,((((((,..{,{{(((((,,,{{{..,..,||,(({(((({.{{....{{{.{{{{{||,..{{||{|}}|||||,,,,|}...},,,..}}}}}.,,{((((((..(..{(({((((....}}}|,((((((({{((,...,..............,|{{....(((((...((((((...{(({,{...,(((((...{|,|||....))}.))...))))))..})))))))))..,)))))....)))).......{{{{,,.(((....,))}|..,,,......,,)))))}}.||.(({{{..{......})),..},,)))},......,,.,{{{{{....{.(((((((..(((.(((.(((((..((((......{{......}}.....})))))))).))).)))....))))))).}...}}}}}|{{{|({...................)))))),})))}})..}))))},..,})))))))))}}..,||}||,||{,{{.(((((...)))))...........{{{.,,...(((((.((((,{((((..{,((.,....((((((.....,......)))))).....)).}}.))))}).)))).))))),,,)}}}),......,|||,.,.}}||,|,.|||....}))),),,...||{{{.....,{,,{{{{,...,{{,,,,,,...|}}))}}}}))|.}}}...}||}}((((((.,,,..}}||,||{..,,.||||||...{|||{|||{|,.........},,,....(((((((.,........((((((((.......)))))))).||.((((...)))).,,.....{(((((((.((((..,...(((((.((((.{(.((((((.((.((((({((((({{(((..((((((......,,({(,,({...(((((........).)))).....}},,))},,,.....)))))),|||.,,},,,.....{{,|,,,,)))),,,........))))))).)))))).)).)))))))))},.))))}))}.,}}}}.||,...,..........)))))))..........),)))))))))),..))})))}...,
Forensic Context

No forensic context available.