Basic Information
Symbol
hsa_CDK13_0002900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0079931
hsa_circCDK13_009
hsa-CDK13_0007
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40027198-40087476
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39987599-40047877
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-339.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-369.91 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
380.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((((((......((..((....)).))......((((((((.((....(((......)))....)).))))))))))))))..))))(.((((.....(((((((..(..((((....(((((.((((((((((.(((....................)))...((((((...((((((...((..((....(((((....)))))....))..))...))))))...))))))))).))))))).....)))))....((((.((((((.(((.((((..(((........))))).(((...))).......)).)).).))).))))))).......((((((....(.(((((((..(((.(((.(((((..((((......((......)).....))))))))).))).)))....))))))).)...))))))((((((...................)))))).))))..)..)))))))....((((..(((((((..(((..((((((.(((((...)))))...........(((.((...(((((.((((.(((((..((.(......((((((............))))))......).))..))))).)))).)))))...)))))........)))))).((((.....(((....))).....)))).....................((((.(((((.((((((((((((.(((....((...(((((.(((....((((((.....))))))....))).))).))...))))).))))....(((((((..........((((((((.......)))))))).((.((((...)))).)).....((((((((.((((......(((((.((((.((.((((((.((.(((((((((((..(((..((((((........(((..((...(((((........).)))).....))..)))........)))))).))).)))))).....((((....))))...........))))))).)))))).)).)))))))))...)))))))).....))))...............)))))))...))))))))...)))))))))...(((..(((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((.(.((((((............))))))).))))))))..............((((((....))))))((((..(((...))).)))).(((....)))..........((((......)))).......)))))).)))))(((((((.....))))))))))))))))..))))..)))))..))).)))..))))..))).)))))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((,.......{,,{{.,..,,.,},.|||.((((((((.{(....{{(,,.,,,||}....}}.)))))}}|}}}}}}..})}}(.((((...,,(((((((..(..{(({((((....}}}|,((((((({{((,...,..............,|{{....(((((...((((((...{({{.{...,(((((...{|,|||....))}.))...))))))..})))))))))..,)))))....}))},......{{{{.,.(((....,))}|..,,,......,,)))))}}.||.(({{{..{......})),..},,)))},.........,,{{{{....{.(((((((..(((.(((.(((((..((((......{{......}}.....})))))))).))).)))....))))))).,...}}}}}|{{{{({...................)))))),})))}})..})))))}....|||||||||{{,{.,||{,,{{{{{{.(((((...)))))...........{{{.{{...(((((.((((,{((((..{,((.,....((((((.....,......)))))).....)).}}.))))}).)))).)))))...)))))........|||},}.||||{{,.{{{....,))).)},..,||,{{.....,,..{{,,.....(({{.{{{{,.|||||||||||{.|||...,||,,{{,(((.(((....((((((.....))))))...,|||,|||,|}....,.,,.}}}}....(((((((.,........((((((((.......)))))))).||.((((...)))).,}.....{(((((((.((((..,...(((((.((((.{(.((((((.((.((((({((((({{(((..((((((......,,({(,,({...(((((........).)))).....}},,))},},.....)))))),|||.,,},,,.....{{,|,,,,)))),,,........))))))).)))))).)).)))))))))},.))))}))}.,}}}}.||,...,..........)))))))....}}}}}}),}}))))))))}...{((..(((((.((((((((((((((((((,{{{{{,((((((((.(.((((((,,.....,,...))))))).)))))))).,,.,{{,.,,,|,|{,,,{,,{.||{{((((....}}}}}}}}}}}|}}|{||,,,{|||,|,,|,,,,.|||||},.,,,,,},},.,.,)})})),}}}}}(((((((.....))))))))))))))))..))))..)))))..))).))),.))),,}}))}}))}}))).)
Forensic Context
No forensic context available.