Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0003200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0134281 hsa_circCDK13_012 hsa-CDK13_0106
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
7:40027198-40102899 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39987599-40063300 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-456.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -488.80 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 376.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.(((((......(((((.(((.......)))(((((((((.((....(((......)))....)).))))))))).((((.((.......((((........)))).......))))))....((((((((((.(((....................)))...((((((...((((((...((..((....(((((....)))))....))..))...))))))...))))))))).)))))))....)))))......))))).)))..(((.((((..(((........)))...((.(.(((((.........))))).).))(((((((.(((((((.(((....(.(((((((..(((.(((.(((((..((((......((......)).....))))))))).))).)))....))))))).)...))))))))))...........(.(((((...((((((((((((....((.(((.....))).)).........(((..((((((.(((((...)))))...........(((.((...(((((.((((.(((((..((.(......((((((............))))))......).))..))))).)))).)))))...)))))........))))))..)))...........(((((((...(((((((.................((((.(((((.((((((((((((.(((....((...(((((.(((....((((((.....))))))....))).))).))...))))).))))....(((((((..........((((((((.......)))))))).((.((((...)))).)).....((((((((.((((......(((((.((((.((.((((((.((.(((((((((((..(((..((((((........(((..((...(((((........).)))).....))..)))........)))))).))).)))))).....((((....))))...........))))))).)))))).)).)))))))))...)))))))).....))))...............)))))))...))))))))...))))))))).((..((((...(((((...((((((..((((....(((((((.((((..(((..((((.(((.((.((((.(((..(((((((((((.(((...)))..))))))..((((((((....))))))))(((((((.(...(((((.......((((..((((.(((....))))))).))))......(((((((.....)))))))..)))))....).))))))).))))).))).)))).)))))))))..)))..)).)))))))))..))))))))))..........)))))))))..)).))))))))))))))......(.(((((((........)).))))).)))))))))))))...))))).)...))))))).......(((((((((((....((((((.(.(((((..................))))).).))))))................((((((((((.......(((...))).......))))))))))(((((((((((.....(((((((......)))))))....(((........)))....))))))))))))))))))))))..(((((((((((...............))).)))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((.(((((......(((((.(((.......}}}(((((((((.((....(((......}))....)).))))))))).((({|((.|.....((((........))))....,..})))))....((((((((((.(((...,,.........,.....)))...{(((((...((((((...((..((....(((((....)))))....))..))...))))))...))))))))),,))))))....)))))......))))).)))..((,,((((..(((........)))...{{,(.(((((.........))))).}.}}(((((((.{{({{{{{{{{....{.(((((((,.(((.(((.(((((..((((......{,......}}.....}}}}))))).))).)))....))))))).,...}}}))))}))..........,{.(((((...(((((((((((({,..((.(((.....))).)).||.,...,{{(..{{{{((.(((((...)))))...........{{{.{{...(((((.((((,{((((..{,((.,....((((((.....,......)))))).....)).}}.))))}).)))).)))))...}}}}}......,,|||}}}.}))}.,..,,.....||||{||,..{((((({........,,,......((((.(((((,((((((((((((.(({....{(..{(,(((.(((....((((((.....))))))....))).))).))...,},}}.)))),...(((((((.,........((((((((.......)))))))).||.((((...)))).,}.....{(((((((.((((..,...(((((.((((.{(.((((((.((.((((({((((({{(((..((((((......,,({(,,({...(((((........).)))).....}},,))},},.....)))))),|||.,,},,,.....{{,|,,,,)))),,,........))))))).)))))).)).)))))))))},.))))}))}.}}}}}.||,...,..........)))))))...,})))))),..)))))))))...(((..(((((.(((({(((((((({((((,{,{({{((((((((.(.((((((,{..,..,},..))))))).)))))))}.,,.,{{,.,,,},|{,,,{,,,.{{{(((((....})))}})}|||||||,{,,,{{{||,,,,,,,{,,|||||},.,,,,.},},,,,,)})))).},,,,(((((((.....)))))))))))))))}..))))..)))))..))),|}|||||,,,,}}},,,,.,,,.,))})||{||,|{{{,..,,||},..,}}}}}.}|)},,},,)),.}},))))))),||||}}......,.{{{{{,.||||{{{{.,.,,,))})}))))))))))).}.))))).}...))))))).......(((((((((({....((((((.(.(((((.....,...........,))))).).))))))................{(((((((((.......(((...))).......)))))))))|((((((((((({,...(((((((......)))))))....(((........)))...,))))))))))))))))))))))..(((((((((((,,{{....,,...,,))}.)))))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.