Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0006100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0005485 hsa_circCDK13_015 hsa-CDK13_0003
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40037093-40087476 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39997494-40047877 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-166.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -182.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 163.49
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.