Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0006200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0134283 hsa_circCDK13_016 hsa-CDK13_0013
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40037093-40102699 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39997494-40063100 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-202.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -222.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 266.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((....))....((.((((((....((((((.................((((.(((((.((((((((((((.(((....((...(((((.(((....((((((.....))))))....))).))).))...))))).))))....(((((((..........((((((((.......)))))))).((.((((...)))).)).....((((((((.((((......(((((.((((.((.((((((.((.(((((((((((..(((..((((((........(((..((...(((((........).)))).....))..)))........)))))).))).)))))).....((((....))))...........))))))).)))))).)).)))))))))...)))))))).....))))...............)))))))...))))))))...))))))))).....((((...(((((...((((((..((((....(((((((.((((..(((..((((.(((.((.((((.(((..(((((((((((.(((...)))..))))))..((((((((....))))))))(((((((.(...(((((.......((((..((((.(((....))))))).))))......(((((((.....)))))))..)))))....).))))))).))))).))).)))).)))))))))..)))..)).)))))))))..))))))))))..........))))))))).(((((..((((..(((((..((...((((((..((((((((......)))..)))).)..)))))).((((.(((...))).)))).....))...)))))))))..)))))))).)))...))).))).)).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(({,,..{{{,...,|||,||,..,|({(({......,.{{{,.....((((.{((((,{(((((({((((.{{{....{{.,(({(((.(((....((((((.....))))))...,}}},))).))...,},,}.)))),...(((((((.,,,,.....((((((((.......)))))))).||.{(((...}))}.}}.....{(({((((.((((..,...(((((.((((.{(.((((((.((.((((({((((({{(((..((((((......,,({(,,({...(((((........).)))).....}},,))},},.....)))))),|||.,,},,,.....{{,|,,,,)))),,,........))))))).)))))).)).)))))))))},.))))}))}.}}}}}.||,.,,,..........)))))))....})}})}).,,)))))))))...{((..(((((.(((({(((((((((((((,{{{(({((((((((.(.((((((,{..,..,|,..))))))).)))))))}.,,.,{{,.,,,},|{,,,{,,,.{{((((((....}))))})}||||||{,{,,,{{{||.,,,,,.{,,{,||||,.,,,,.}.},,,,,)})))).},,,,(((((((.....)))))))))))))))}..))))..)))))..))}||},||||.,,|}}}||},.,,,.,})}}||{||,{{{{,..,{|||,...}}}}}.|||},.,,.)}.(((({..{(({..{(({{..,,...((((((..((((((((......)))}.}))).)..)))))).{(((.(({...})).)))}.....,,...})))}))))..))))).,,,}}}...,,,.,...,,.,..}
Forensic Context

No forensic context available.