Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0008300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0134284 hsa_circCDK13_018 hsa-CDK13_0014
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40038960-40087476 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39999361-40047877 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-119.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -131.96 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 116.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(.(((((....((.((((...)))).))..............((((......(((((.((((.((.((((((.((.(((((((((((..(((..((((((........(((..((...(((((........).)))).....))..)))........)))))).))).)))))).....((((....))))...........))))))).)))))).)).)))))))))...)))).(((((((((.((..(((..((..........)).)))..)).)))))))))....((.(((((..(((((.((((((((((((((((((.((((((((((((((.(.((((((............))))))).))))))))..............((((((....))))))((((..(((...))).)))).(((....)))..........((((......)))).......)))))).)))))(((((((.....))))))))))))))))..))))..)))))..))).)).)).......))))).)......
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{.(((((.,..({.((((...}))).}}..............((((..,...(((((.((((.{(.((((((.((.((((({((((({{(((..((((((......,,({(,,({...(((((........).)))).....}},,))},},.....)))))),|||.,,},,,.....{{,|,,,,)))),,,........))))))).)))))).)).)))))))))},.)))),(((((((((.((..(((..{(.......,..)).)))..)).)))))))))}...{{.{{(((..(((((.((((((((((((((((((,{{{{{,((((((((.(.((((((,,.....,,...))))))).)))))))).,,.,{,,.,,,|,|{,,,{,,{.||{{((((....|||}}}}}}}},}||{{|{{,{|||,|,,|,,,,.||||}}...,,,,},},...,)))))),)}}}}(((((((.....))))))))))))))))..))))..)))))..))).)).}}..,,...))))).}......
Forensic Context

No forensic context available.