Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0008500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0134286 hsa_circCDK13_020 hsa-CDK13_0016
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40038960-40118450 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39999361-40078851 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-229.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -250.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 295.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....(((.((((..((....(((((((((((..........(((.((((......(((((.((((.((.((((((.((.(((((((((((..(((..((((((........(((..((...(((((........).)))).....))..)))........)))))).))).)))))).....((((....))))...........))))))).)))))).)).)))))))))...)))))))...((((((((.(((.......))).))).))))).........)))))).)))))....))....)))).)))....(((((((.........((((((((.(.((((((............))))))).))))))))...(((((.............)))))((((((....))))))((((((...(((....)))....(((((....(((((..((.(((((.....(((((((((((((((((.....))))))((((.......)))).((((((...((.(((.........)))..))...))))))((.((..(((((..(((((....))))).))))).)).)).............((((.................)))).....))))).)))))).......)))))))..))))).)))))..........(((((((((.........((((((((((((................(((......)))(((.((.(((.(.((((((((((...(((((((((((........(((((......)))))....((((((((..((.((...........)).))..))))))))..((..((......))..))....)))))))))))((((((...........)))))))))))))))).).))))))))....))))))))))))..))))))))).))))))...........)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,{{{{{(({{,,{,,({.,{|{||,||||,||......}|}||..,(((({,....(((((.((((.,{.((((((.((.(((((,{{{(({((({,.((((((.......{((({.(,...(((((,.......}.)))).....|||.}}||||.....}))))).|||.,,,,,,.....,,||}}}}})))},,........})))))}.}))))}.)).)))))))))|,.}}}|||{{{{((((.((..(((..,{....,..}..}).))}..}}.}}}})))))}.,,||,,,{((..(((((.((({{((((((((((({(,{{{{{,((((((((.(.((((((,,.....,,,..))))))).)))))))).,,.,{{,...,|,|{,,,{,,,.||{{((((....})))}}}||||{||{{{{,,,{{||.,,,|,,{,,|,||||,.,,,,.},},,,,,)})})),},,,,(((((((.....)))))))))))))))}..))))..)))))..))},||.||..{{{({({((((.,{...{{{{({{(,,{{{(,..{{(||....,}}}},))))},}},},..)})}.}}}}),}}}}).,......{{{{{{..{(((((((......})}}.}))),),,)))))),||||}|||,}.,)).}}},....,|||||||||.,,......((((((((((((................,{.......,||(((,({.(((.{.((((((((((...(((((((((((........{((((......))))}....((((((((..((.((...........)).))..))))))))..,,.,((......))..),....)))))))))))((((((...{,...},})))))))))))))))).).)))))))),.,.)))))))))))),,)))))))})},..,,,......,,.)))})))),
Forensic Context

No forensic context available.