Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0009000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0134288 hsa_circCDK13_022 hsa-CDK13_0026
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40041460-40118450 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40001861-40078851 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-192.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -211.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 228.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.