Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0010500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0079935 hsa_circCDK13_026 hsa-CDK13_0023
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40085435-40127930 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40045836-40088331 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-229.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -245.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 162.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...((((((..((((....(((((((.((((..(((..((((.(((.((.((((.(((..(((((((((((.(((...)))..))))))..((((((((....))))))))(((((((.(...(((((.......((((..((((.(((....))))))).))))......(((((((.....)))))))..)))))....).))))))).))))).))).)))).)))))))))..)))..)).)))))))))..))))))))))..........))))(((((((.(((.(((((.((((((......(.(((((((........)).))))).)((((((((((((((((..(((....(((((.((.....(((((((.(((.........((((((((((((................(((......)))(((.((.(((.(.((((((((((...(((((((((((........(((((......)))))....((((((((..((.((...........)).))..))))))))..((..((......))..))....)))))))))))((((((...........)))))))))))))))).).))))))))....))))))))))))..(((((.(((......((....))......))).))))).....((((((....))))))))).))))).))....)).)))))..............((((.(((.((..((....))..)).)))..))))((((((........)).))))))).)))).)))))(((..((.((((((....)))))).))...))).)))))))....))))))))))).)))...)))).))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...((((((..((((.,..(((((((.((((..(((..((((.(((.((.((((.(((..(((((({{{{,.((,...,,,,,}}}},,..{(((((((....)))))))}{((((((.(...(((((.......((((.,(({{.{{{....}}},))).))))......(((((((.....)))))))..)))))....).))))))})))))).))).)))).)))))))))..)))..)).))))))))),.))))))))))..........))))(((((((.(((.(((((.((((((......(.((((({{........)).))))).)(((((((((((({({(,{{({....{(({{.||,....,,{{{{{.{{{,.,......((((((((((((................,{.......,||(((,({.(((.{.((((((((((...(((((((((((........{((((......))))}....((((((((..((.((...........)).))..))))))))..,,.,((......))..),....)))))))))))((((((...{,...},})))))))))))))))).).)))))))),.,.))))))))))))..(((((,(((,.....,,....,}..,,,,)}}.))))),..{{((((({....))))))))).}}))),)}....}),,))),..,,,{,,||,..,{(({.{..,|,,,,,}}},}),,,,.,..,{||||,{{({,......,.))})))))))})))}|,)))){{,..{{.((((((....)))))).))...))}.)))))))....))))))))))).)))...)))).))..)
Forensic Context

No forensic context available.