Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0013100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0079941 hsa_circCDK13_032
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
7:40117604-40132836 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:40078005-40093237 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-242.44 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -258.69 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 237.10
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......((((((....)))))).(((.((.(((((((((((((((............(((((......)))))....((((((((..((.((...........)).))..))))))))............(((((.......(((((((.(((..((.((((.....((((((.(((((((((((..((......))..))))))).(((((..........)))))......(((((((((((((((.((((((((((.(((..(((.(((.((((.............((((..((((((.......((((((..((.(((....((((.(((.((((..(((....(((((((..((((((..((((((((((..(((((((..((.((((((....)))))).))...))).....))))..))).((((((.((......)).)).))))......))))))).))))))((((........)))).(((((((................................))))))).((((((.....(((..((.(((..((......)).))).))..))).......))))))...........))))))))))..)))).))).)))).........))).))..))))))....((......)).)))))).....))))((((((.......)))))).))))))).)))..)))))))).))))))))..(((((....))))).)))..))).))))))....((((((((((((((((......))))..).)))))..))))))....))))))))))....)))).)).))))))))))......))))).))))))..))))))))))).)))..((..((((....)))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,...,,,{,({{{{||,,{{.(((.((.(((((((((((((((,,,,........{((((......))))}....((((((((..((.((...........)).))..))))))))......{{....,,||,.},....|||||||,||{,,((.((({.,.{,({{{{,,(((({((((((,.({.....,}}..))))))({((((({({{,,,,,{||},,.,.,..,,,{|,,|||||||{,||||((((((,(((,.{{,,|||,||||....,,.......{(((..((((((.......((((((..((.(((.{..((((.(((.((((..(((...,(((((((..,(((((..((((((({{{,.{{({{{......((((((....)))))),||{|||}|{,..,|{||...,,.{{{{{|,||,.....)),)).}))),.....))))))).)))))}((((........}}}}.,{(({,,......,,......................}}))}}.,,.((((((.....(((..((.(((..{(......}}.))).))..)))..,,...))))))...........)))))))))),.)))).))).)))).........))).))..))))))....((......)).)))))).....)))),|||||}}}}}..||||||,}||||}}.}||,,}}}}}}}},)))}})))..(((((....))))).}}|||}||,||}}}},,,.{(((((((((({((({......))))..).))))}..)))))}....)))))})))),,,,)))).,,.}})))))))}.,....}}}}},,}}}}}..))))))))))).))).}}...|.}}}}),)|,,..)
Forensic Context

No forensic context available.