Basic Information

Symbol
hsa_CDK13_0000800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-CDK13_0079
Host gene
CDK13
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
7:40007394-40008595 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
7:39967795-39968996 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-286.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -311.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 354.00
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((((......(((((((((((((((.......((((((((((.((..(((((((((......))))).))))....((.(((....))).)).................((((.(((((.....((.((..(((((((..(((.....)))))))))).)).)).....))))).))))............(((((......)))))......)).))))))))))......(((.((((((((....)))).......(((((((((....(((((..........)))))...............)))))))))((.(((((((((.........))))))))).))(((((((((.....(((........)))...)))))...))))((((.((((((..(((((((((((...)))))))............((((((.......................(((((.((.((.(((((((...................))))))).....)))).))))).....(((((.((((((((......)))).)))).))))).....................((((.............))))(((((((((....)))...))))))....(((((((((((((((..(((..(((.(((....(((.(((((((........((((((..(....)..)))))).....((((((((((....))))......((((...((((((((.(((((((....)))))))..((((.((....(((((......)))))..)))))).....)))))))).........))))......((((........))))..)))))))))))))...)))))).))).)))))))))..)))))))))..))))))))))..)))))).))))((((((((((.((.((((((..........(((((.((.((....)).)))))))........)))))).))))))))))))))))))).((((((((((...))))))))))........))))))))....))))))).........))))).....)((((.(...((((((((((((.(((.............))))).)))))))))).........(((..((((...))))..)))................).))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((({...,,,((((((,,{{(((((.,.....((((((((((.((,.(((((((({......})))).))))....((.(((....))).)){((({.....}))},..((((.(((((...,.((.((..(((((((..({,.....,),))))))).)).)},,...))))).))))........,{,.(((({......))))}..,.,.}}.))))))))))....,,,,,{((({((((....))))}}}|.|....,{((,,....(((((.{,....,}.)))))......,,....,.,}||||||}|{{.(((((((((.........))))))))).))|{{,(((((.....(((........))).,.))))).,,}},,,,,..,{,,,,..{{.((((..((({((((((((({.........,{,..{{.......,.........,.....(({((.{{.,,.{((((((..........,,.......))}))}}.....},||,||||}......{{{{.{{{{{{{,.....,))||.}}||,|||||............,..}}}}}}|(((..{,.{{{{....,,||(((((({(......,},,.))))))....||||.||.,|}}{((({({.{({{(({((....)))))}})})},}},,.,)}}}))))))))))}.))).)))}..}}}|}}},{{||,,,,)))}.....|,,,||,,{{|,{|||.(((((((....)))))))..((((.{{....(((((......)))))..}})))),||,,,|||}}||{,,,,,,{({(({{,{......,{{{{{{...{({,,{{({.{{{{,..|{{{{.,,}...))}}}....})))..,)))))))}..))))))}}}..})))})))))|{((((((((,,((.((((((,.,,.....,{{{{||,{.{|....)),))|}))).......,}))))}.)))))))))))}|...,,|.((((((((((...)))))))))),,.,,...|||||||},.,|||||},...,{,....,,,,),,...,{{({.....((((((((((((.{((.............)))))}}))))))))).........|||,,|{||,,.)))}.,))).,......,,,.....,,))))
Forensic Context

No forensic context available.